1. Gene
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SDS - serine dehydratase Gene

中文名称:丝氨酸脱水酶

种属: Homo sapiens

同用名: SDH

基因 ID: 10993 | 基因类型: protein coding

关于 SDS

Cytogenetic location: 12q24.13 Genomic coordinates (GRCh38): 12:113,392,445-113,403,887 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 199 orthologues and 5 paralogues. Biased expression in liver (RPKM 130.0) and brain (RPKM 4.0).

功能概要

该基因编码参与丝氨酸和甘氨酸代谢的三种酶中的一种。 L-丝氨酸脱水酶将 L-丝氨酸转化为丙酮酸和氨,并且需要磷酸吡哆醛作为辅助因子。编码的蛋白质还可以将苏氨酸代谢为 NH4+ 和 2-酮丁酸。编码的蛋白质主要存在于肝脏中。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes one of three Enzymes that are involved in metabolizing serine and glycine. L-serine dehydratase converts L-serine to pyruvate and ammonia and requires pyridoxal phosphate as a cofactor. The encoded protein can also metabolize threonine to NH4+ and 2-ketobutyrate. The encoded protein is found predominantly in the liver. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SDS 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006843.3 NP_006834.2 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables L-serine ammonia-lyase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15618015 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables protein homodimerization activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15689518 GOA
enables pyridoxal phosphate binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15689518 GOA
enables pyridoxal phosphate binding IMP
IMP: 通过突变表型推断
16580895 GOA
enables threonine deaminase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15618015 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in L-serine catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
15689518 GOA
involved in pyruvate biosynthetic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
15689518 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SDS 蛋白结构

PALP

PALP: Pyridoxal-phosphate dependent enzyme (9 - 304)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 328 a.a.
蛋白主名 其他名称

L-serine dehydratase/L-threonine deaminase

L-serine ammonia-lyase

SDS 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SDS P20132 TGM7 Homo sapiens Q96PF1
Validated Y2H
32296183
种属内
SDS P20132 DDI1 Homo sapiens Q8WTU0
Validated Y2H
32296183
种属内
SDS P20132 DDI1 Homo sapiens Q8WTU0
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SDS P20132 DDI1 Homo sapiens Q8WTU0
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Breast Abscess

Abscess Of Breast

Atrial Septal Defect 1

ASD1

Atrial Heart Septal Defect 1

Asd

Schizophrenia 1

SCZD1

Schizophrenia Susceptibility Locus, Chromosome 5-Related

Schizophrenia 1 With Or Without An Affective Disorder

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus SDS VGNC VGNC:80482
Rattus norvegicus SDS RGD RGD:67376
Bos taurus SDS VGNC VGNC:34399
Mus musculus SDS MGD MGI:98270
Macaca mulatta SDS VGNC VGNC:77148