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PGGT1B - protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta Gene

中文名称:蛋白质香叶基香叶基转移酶 I 型亚基 beta

种属: Homo sapiens

同用名: BGGI; GGTI

基因 ID: 5229 | 基因类型: protein coding

关于 PGGT1B

Cytogenetic location: 5q22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:115,204,012-115,262,877 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 201 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in colon (RPKM 3.0), spleen (RPKM 2.3) and 25 other tissues.

功能概要

型蛋白质香叶基香叶基转移酶 (GGTase-I) 将香叶基香叶基转移到含有 C 端 CAAX 基序的候选蛋白质的半胱氨酸残基上,其中“A”是脂肪族氨基酸,“X”是亮氨酸 (由 Zhang 等人总结, , 1994 [PubMed 8106351]) 。该酶由一个 48-kD α 亚基 (FNTA;MIM 134635) 和一个 43-kD β 亚基组成,由 PGGT1B 基因编码。 FNTA 基因编码 GGTase-I 和相关酶法尼基转移酶的 α 亚基。[OMIM 提供,2010 年 3 月]

Protein geranylgeranyltransferase type I (GGTase-I) transfers a geranylgeranyl group to the cysteine residue of candidate proteins containing a C-terminal CAAX motif in which 'A' is an aliphatic amino acid and 'X' is leucine (summarized by Zhang et al., 1994 [PubMed 8106351]). The Enzyme is composed of a 48-kD alpha subunit (FNTA; MIM 134635) and a 43-kD beta subunit, encoded by the PGGT1B gene. The FNTA gene encodes the alpha subunit for both GGTase-I and the related Enzyme farnesyltransferase.[supplied by OMIM, Mar 2010]

PGGT1B 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005023.4 NP_005014.2 geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24981860 GOA
enables protein geranylgeranyltransferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
16893176 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in protein geranylgeranylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
16893176 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of CAAX-protein geranylgeranyltransferase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
16893176 GOA
part of CAAX-protein geranylgeranyltransferase complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8106351 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PGGT1B 蛋白结构

SQHop_cyclase_N

SQHop_cyclase_N: Squalene-hopene cyclase N-terminal domain (119 - 209)

Prenyltrans

Prenyltrans: Prenyltransferase and squalene oxidase repeat (244 - 283)

Prenyltrans

Prenyltrans: Prenyltransferase and squalene oxidase repeat (290 - 332)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 377 a.a.
蛋白主名 其他名称

geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta

CTC-428G20.3

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus PGGT1B VGNC VGNC:32788
Canis familiaris PGGT1B VGNC VGNC:44459
Mus musculus PGGT1B MGD MGI:1917514
Felis catus PGGT1B VGNC VGNC:68814
Macaca mulatta PGGT1B VGNC VGNC:75965
Rattus norvegicus PGGT1B RGD RGD:621754