2. 一站式药筛
  3. 化合物库
  4. 虚拟筛选

Virtual Screening

FAQ

虚拟筛选 (Virtual Screening, VS) 是基于小分子数据库开展的活性化合物筛选。利用小分子化合物与药物靶标间的分子对接运算，虚拟筛选可快速从几十至上百万分子中，遴选出具有成药性的活性化合物，大大降低实验筛选化合物数量，缩短研究周期，降低药物研发的成本。据报道虚拟筛选的阳性率为5%-30%，利用虚拟筛选成功辅助药物设计的案例逐年增多，虚拟筛选已成为目前最有潜力的药物开发工具。

MCE 拥有丰富的数据库资源、高性能的计算机服务器，可提供专业的分子对接、虚拟筛选服务。经优化的虚拟筛选方案可大规模减少需实验筛选的化合物数量，提升理想先导物发现的可能性，缩短虚拟筛选服务时间，同时降低后期先导物优化失败的风险。针对具体需求，可量身定做高性价比的服务方案，为广大科研客户提供优质的早期药物研发服务。

Virtual Screening

MCE 虚拟筛选助力顾客发表的科研文献（部分）

虚拟筛选数据库资源

虚拟筛选流程

虚拟筛选方法主要分为基于受体生物大分子结构的虚拟筛选 (structure-based virtual screening, SBVS) 和基于配体小分子的虚拟筛选 (ligand-based virtual screening, LBVS) 两种。

•   SBVS 基于受体的虚拟筛选

基于受体的虚拟筛选即基于分子对接的虚拟筛选，是根据实验测定的或同源模建的受体生物大分子的三维结构，通过分子对接的方法，确定小分子与受体的结合构象，根据与结合能相关的亲合性打分函数对蛋白和小分子化合物的结合能力进行评价，最终从大量的化合物分子中挑选出结合模式比较合理的、预测得分较高的化合物，用于后续的生物活性测试。

•   LBVS 基于配体的虚拟筛选

基于配体的虚拟筛选即基于药效团模型的虚拟筛选，是根据现有药物的结构、理化性质和活性关系的分析，建立定量构效关系或药效基团模型，预测筛选新化合物的活性。

服务内容

MCE 向广大具有虚拟药物筛选需求的客户提供整套虚拟药物筛选服务，客户只需提供靶标相关的生物学信息，我们将为您筛选最优的活性化合物，为进一步的生物活性评价奠定基础。服务内容包括：

•   靶点调研

•   模型构建

•   小分子化合物库制备

•   分子对接筛选/药效团建模及筛选

•   人工挑选

•   理想实体化合物的组库

MCE SBVS Protocol

服务优势

•   高性能的计算机服务器

•   丰富的数据库资源，包含1600万+ 可购买化合物

•   专业的分子模拟和药物设计团队

•   高度标准的数据隐私管理

•   具有竞争力的价格优势

数据库资源

Cat. No. 虚拟筛选库类别 分子数量 特点
HY-L001V MCE Bioactive Compound Library 23,562 MCE活性化合物数据库，含有 23,562 种已知高活性的化合物集合，结构多样，是老药新用、新适应症筛选的有效工具。国内现货供应。
HY-L032V MCE Fragment Library 22,500 基于 RO3 原则精选 22,500 种片段化合物，用于 FBDD。国内现货供应。
HY-L0051V HTS Compound Library 1,363,233 包含 1,363,233 种具有独特结构和性质的化合物，数量大，结构多样性丰富。
HY-L0052V Advanced Library 957,777 包含 794,208 种类先导化合物，化合物的多官能团和类先导化合物的特性使 Advanced 库成为先导化合物发现的有效工具。
HY-L0053V Premium Library 61,626 59,730 种最具最佳分子特性 (高 Fsp3、低 logP 和 MW ) 的化合物集合，精选库。
HY-L0113V 1M Drug Fragment-Based Diversity Library 1,000,000 精选 1,000,000 种带有药物片段的多样性化合物。每个分子至少有一个药物片段，这些药物片段来自 FDA 批准的 2,946 个药物分子。该库骨架多样性丰富，含有 702,902 个独特的 BMS 骨架，适用于 AI 药物筛选、大型虚拟筛选等。
HY-L0072V Agro-like Library 10,240 来源于 Enamine, 用于农业/作物科学的化合物库。
HY-L0059V Allosteric GPCR Library 14,400 来源于 Enamine, GPCR 数据库子库，用于发现新的 GPCR 变构配体。
HY-L0063V Allosteric Kinase Library 4,800 来源于 Enamine, 通过分子对接等精心挑选的变构激酶抑制剂。
HY-L0097V Antibacterial Library 32,000 来源于Enamine，包含 32,000 个新型抗菌化合物，适用于高通量(HTS)筛选。
HY-L0073V Antiviral Library 3,200 来源于 Enamine, 包含 3 种用于发现抗病毒药物的化合物。
HY-L0074V Aquaporins Library 1,500 来源于 Enamine, 包含靶向水通道蛋白的 1,500 种的化合物。
HY-L0120V Asinex BioDesign Library 170,269 来源于 Asinex，包含 170,269个 具备较高饱和度（av.Fsp3>0.5)，多手性中心（av.≥2）和多样性的分子。该库化合物含有已知药理学相关天然产物（如生物碱和其他次生代谢物）的关键结构特征，药物分子优势骨架（如螺环、桥环、稠环等），适用于AI药物筛选，虚拟筛选等。
HY-L0122V Asinex CNS Macrocycles Library 1,122 来源于 Asinex，包含1,122个高CNS-like的多样性分子，其中CNS-MPO > 4，CNS-MPO.v2 > 4， CNS-TEMPO < 4。适合用于中枢神经系统相关药物的发现和研究。
HY-L0118V Asinex Covalent Inhibitors Library 942 来源于 Asinex，包含 942 个含有亲电性基团的共价分子，有可能与目标蛋白质中的亲核性残基发生相互作用，是发现共价抑制剂的有效工具。
HY-L0117V Asinex Macrocycles for Glycomimetics Library 1,412 来源于 Asinex，包含 1,412 个大环拟糖物。化学空间介于大分子和小分子之间，大环拟糖物是海洋微生物和细菌或真菌的代谢产物的天然产物代表。
HY-L0116V Asinex Macrocycles for RNA Library 1,065 来源于 Asinex，包含 1,065 个含有靶向 RNA 特征、具备类药性和多样性的大环分子，用于发现靶向 RNA 分子。
HY-L0115V Asinex Macrocycles Library 10,091 来源于 Asinex，包含 10,091 个结构新颖、多样的大环分子。该库分子溶解性和透膜性具有一定的优势，是新药发现的有力工具。
HY-L0119V Asinex PPI Pre-Plated Library 3,253 来源于 Asinex，包含 3,253 个具备各种大小和形状的PPI分子，是 PPI 药物发现和相关研究的有用工具。
HY-L0075V BACE Library 7,171 来源于 Enamine, 靶向 β-分泌酶 (BACE) 的小分子化合物库。
HY-L0098V Calcium Ion Channel Library 10,560 来源于Enamine，包含10,560 个可能得钙通道阻滞剂，适用于高通量(HTS)筛选。
HY-L0124V Chemspace CNS-Focused Library 13,082 来源于Chemspace，包含13,082个非极性且不含PAINS/有毒片段的小分子化合物，符合穿透血脑屏障的理化性质要求。
HY-L0091V Chemspace Lead-Like Compound Library 1,367,511 来源于 Chemspace，包含 1,367,511 个 类先导化合物，结构多样，适用于高通量筛选。
HY-L0093V Chemspace Scaffold derived set 10,119 Chemspace骨架库，精心选择3,373个骨架，每个骨架3个化合物，在骨架基础上添加官能团，增加化合物空间结构覆盖率。
HY-L0094V Chinese National Compound Library 1,398,968 国家化合物样品库有近140万个化合物，具有结构多样化、存储专业化、管理集中化、信息系统化和质控标准化等特点。
HY-L0065V CNS Library 56,320 来源于 Enamine, 具有高 CNS MPO 得分的小分子化合物数据库。
HY-L0076V Covalent Screening Library 11,760 来源于 Enamine, 带有 "弹头" 结构可用于共价靶向修饰的化合物集合。
HY-L0054V Discovery Diversity Set 10 10,240 Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) 专注于新型化合物结构式，适合新型化合物的随机筛选。DDS 库含有共60,480个新型化合物。Discovery Diversity Set 10 由高度特异且不重复的 10 个化合物组成。
HY-L0055V Discovery Diversity Set 50 50,240 Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) 专注于新型化合物结构式，适合新型化合物的随机筛选。Discovery Diversity Set 50 是 Discovery Diversity Set 10 的补充，由 50,240 个化合物组成。
HY-L0077V DNA Library 5,760 来源于 Enamine, 靶向 DNA 稳定性必需蛋白质的化合物库。
HY-L0078V Epigenetics Library 38,080 来源于 Enamine, 靶向表观遗传靶标如 DNA 甲基转移酶、组蛋白甲基转移酶的化合物库。
HY-L0101V FCH Group Screening Library 2,244,487 来源于 FCH Group，包含 2,244,487 个全新的类先导物化合物，适用高通量筛选（HTS）。
HY-L0079V Glycomimetic Library 2,470 来源于 Enamine, 能够模拟糖苷及其与蛋白质的相互作用的化合物集合。
HY-L0058V GPCR Library 54,080 来源于 Enamine, 靶向 GPCR 的数据库。
HY-L0056V Hit Locator Library 200,000 Enamine Hit Locator Library (HLL) 是一个相当大的高度多样化的化合物库，由 200,000 个类先导物化合物组成。
HY-L0070V IDO Targeted Library 1,003 来源于 Enamine, 靶向吲哚胺2,3-双加氧酶 (IDO) 的化合物库。
HY-L0067V Immuno-Oncology Library 52,935 来源于 Enamine, 专为在免疫肿瘤治疗领域发现新型化合物而设计。
HY-L0105V InterBioScreen Synthetic Compounds Library 485,000 来源于 InterBioScreen，包含 485,000 个功能杂环类药化合物，适用于高通量筛选（HTS）。
HY-L0064V Ion Channel Library 36,800 来源于 Enamine, 用于发现新的离子通道配体。
HY-L0071V JAK/STAT Compound Library 1,390 来源于 Enamine, 靶向 JAK-STAT 信号途径的化合物库。
HY-L0062V Kinase Hinge Binders Library 22,720 来源于 Enamine, 靶向 ATP 结合口袋的激酶抑制剂。
HY-L0061V Kinase Library 65,200 来源于 Enamine, 用于发现新的蛋白激酶抑制剂。
HY-L0068V Kynurenine Pathway Library 12,300 来源于 Enamine, 包含 12,300 个靶向犬尿氨酸代谢途径关键酶的新型化合物。
HY-L0088V Life Chemicals 50K Diversity Library 50,240 Life Chemicals 50K Diversity Library 是一个相当大的高度多样化的化合物库, 由 50,240 个类先导物化合物组成。
HY-L0123V Life Chemicals CNS Focused Screening Library 30,300 来源于Life Chemicals，包含30,300个结构多样、有利于血脑屏障渗透的筛选化合物，用于CNS活性药物的药物开发。
HY-L0087V Life Chemicals HTS Compound Collection 503,810 来源于 Life Chemicals , 包含 503,810 个化合物, 多样性丰富, 适用于高通量筛选。
HY-L0107V Life Chemicals Natural Product-like Compound Library 13,236 来源于 Life Chemicals，包含 13,236 个类天然产物化合物。通过指纹图谱相似性、子结构搜索、天然产物衍生等方法获得。现货供应。
HY-L0060V Lipid GPCR Library 5,440 来源于 Enamine, GPCR 数据库子库，用于发现新的脂质 GPCR 配体。
HY-L0080V Lipoxygenase Library 1,388 来源于 Enamine, 通过分子对接和 2D 相似性搜索的脂氧合酶 (LOXs) 抑制剂化合物库。
HY-L0092V Maybridge Screening Collection 53,000 来源于Maybridge，包含53,000种高度多样的类先导化合物，是药物筛选的有效工具。
HY-L0121V MCE 10K Natural Product-like Compound Library 10,000 精选10,000个来自类药多样库的分子，含有天然产物关键骨架或者和天然产物相似性大于0.6且Natural-likeness scoring>-2，库中分子含有现货，适用于高通量筛选，虚拟筛选，AI药物筛选等。
HY-L912V MegaUni 10M Virtual Diversity Library 10,000,000 10,000,000个可合成的类药多样性化合物集合。适用于AI药物筛选、大型虚拟筛选及新先导物发现等。
HY-L910V MegaUni 50K Virtual Diversity Library 50,000 50,000个新颖的类药多样性化合物集合。库中化合物1-2步反应可合成。适于新型先导物发现等。
HY-L0081V Molecular Chaperones Library 2,468 来源于 Enamine, 包含靶向分子伴侣的 2,468 个化合物。
HY-L0082V Nucleoside Mimetics Library 290 来源于 Enamine, 包含 290 个核酸类似物。
HY-L0095V OTAVAchemicals Screening Collection 270,000 来源于OTAVA chemicals，包含270,000 个结构多样的化合物，适用于高通量(HTS)筛选。
HY-L0114V Pharmeks Screening Compound Library 439,804 来源于 Pharmeks，包含 439,804 个新型的高质量的分子，结构多样，适用于AI药物筛选，虚拟筛选等。
HY-L0100V Phenotypic Screening Library 5,760 来源于Enamine，包含5,760个化合物，为表型筛选创建的特殊多样性库。
HY-L0083V Protein Mimetics Library 8,960 来源于 Enamine, 包含靶向 α-螺旋和 β-转角结构域的 8,960 种化合物。
HY-L0066V Protein-Protein Interaction Library 40,640 来源于 Enamine, 用于发现新的 PPI 抑制剂。
HY-L0106V Protein-Protein Interaction Modulators Library 2,906 PPI 调节剂发现和相关研究的有用工具。
HY-L0084V RNA Library 15,520 来源于 Enamine, 可能结合 RNA 的化合物库。
HY-L0069V Serine Hydrolase Library 12,040 来源于 Enamine, 可能与丝氨酸残基形成共价键的精选化合物库。
HY-L0099V Sodium Ion Channel Library 5,440 来源于Enamine，包含5,440 个化合物，旨在发现新的钠通道阻滞剂。
HY-L0086V Specs HTS Compounds Library 200,382 来源于 Specs, 包含 200,382 种化合物，多样性丰富，适用于高通量筛选。
HY-L0085V Tubulin Library 3,454 来源于 Enamine, 靶向微管蛋白的化合物库。
HY-L0104V UORSY New Generation Screening Library 1,900,000 来源于 UORSY，包含超过 1,900,000 种类先导物化合物，适用于高通量筛选（HTS）。
HY-L0103V UORSY Screening Library 680,000 来源于 UORSY，包含超过 680,000 种聚合法合成的结构高度多样的化合物，适用于高通量筛选（HTS）。
HY-L0096V Vitas-M Screening Compounds Library 1,400,000 来源于 Vitas-M Laboratory，包含超过1,400,000 个可用于高通量筛选的类先导化合物。

MCE 虚拟筛选服务可以显著提高先导化合物命中率并降低后期的实验筛查成本。虚拟筛选技术服务是一种个性化定制的创新型的科研服务，每个项目需经评估后才能确定对应的分析方案和价格。进一步了解服务价格或技术详情等信息，请发邮件至 sales@MedChemExpress.cn 或直接联系 MCE 的销售人员。

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