DNA 编码化合物库合成与筛选

DNA 编码化合物库（DNA Encoded compound Library，DEL）技术作为新颖、强大的苗头化合物发现引擎，可快速从几千万至数十亿分子中，遴选出结构新颖、具有潜在成药性的化合物，大大缩短药物研究周期，降低研发成本。在 DEL 库中，每一个分子砌块（Building Block）都由一段已知唯一的 DNA 序列进行标记，通过 DNA 兼容反应和组合化学模式，历经数个循环即可获得上亿 DEL 分子。数十亿化合物可以混合在一管中筛选，最终通过高通量测序技术，解码 DEL 分子的专属 DNA 标签，快速获得针对靶点的苗头化合物信息。

图1. DEL 库的构建和筛选

DNA 编码化合物库构建、合成

分子砌块是 DEL 库设计、合成的基础。基于 50000 余种高质量、结构多样的分子砌块， MCE 优中择优，剔除 DNA 嵌入剂、含 N-卤代、重金属等的“不良”化学结构，保留骨架独特、结构新颖、官能团多样、化学空间覆盖范围广的化合物。结合 MCE 自主开发的数百种 DNA 兼容性化学反应，最终构建出化学空间多样、结构新颖、包含数十亿化合物的 DEL 库。

图2. DEL 库的构建

DEL 库规格

3 个量级：

• DEL A Kit：

  20 个 DEL 库，3 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL B Kit：

  50 个 DEL 库，10 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL T Kit：

  68 个 DEL 库，20 亿个 DEL 分子，1 管集合

Mini DEL 库：

• DEL C Kit 共价库：

  5 个 DEL 库，0.03 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL D Kit 环肽库：

  5 个 DEL 库，0.08 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL E Kit 常规库：

  5 个 DEL 库，1.9 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL F Kit 常规库：

  5 个 DEL 库，1.09 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL G Kit 常规库：

  5 个 DEL 库，1.13 亿个 DEL 分子，1 管集合

• DEL H Kit 常规库：

  10 个 DEL 库，5.5 亿个 DEL 分子，1 管集合

2 种规格：

• 5 nmol、20 nmol

DEL 库优点

• •68 个 DEL 库，数十亿 DEL 分子
• •化学结构新颖，化学空间覆盖范围广，具备类药分子特性
• •强大的合成能力
• •严格的质量控制、验证体系
• •完善的产品、数据管理系统
• •紧跟研究趋势，不断更新

DNA 编码化合物库定制服务

MCE 不仅可以提供一站式的 DEL 筛选服务，更有热门的光交联 DEL 库、共价 DEL库、环肽 DEL 库等 DEL 库供选择，同时可提供 DEL 库定制服务，根据具体化合物结构类型，快速的衍生合成出数以百计的 DEL 分子。MCE 拥有强大而专业的 DEL 合成团队，紧跟科学前沿开发了数百种 DNA 兼容的化合物反应。

DNA 编码化合物库筛选

相较于传统的高通量筛选，DEL 筛选可以一次性筛选数以亿计的化合物；大大节约靶蛋白的使用量；筛选周期大大缩短；筛选成本更加低廉。DEL 库的筛选策略基本流程是将 DEL 库与靶标进行孵育后，基于小分子-蛋白质的亲和结合作用力，经过不同的洗脱方式，除去非结合小分子，实现具有高亲和力的小分子配体的高倍富集，结合 PCR 扩增与下一代测序的技术，可根据小分子的 DNA 标签实现化合物信息的解码。

图3. DNA 编码化合物的筛选策略：固相筛选

DEL 库筛选流程

• a.蛋白固载与孵育：将待筛选的靶蛋白预先固载，随后将固载的蛋白质与 DEL 库孵育。
• b.洗杂：洗去不与蛋白结合或结合力弱的 DEL 分子。
• c.洗脱：将与蛋白结合的 DEL 分子洗脱，实现高亲和力小分子的富集。
• d.PCR 扩增与蛋白结合 DEL 分子的 DNA 标签。
• e.高通量测序与数据分析：对扩增后的 DNA 标签进行下一代测序，根据 DEL 小分子的 DNA 标签实现化合物信息的解码。

DEL 库筛选优点

• •一站式服务：DEL 库合成与 DEL 库筛选
• •少量蛋白样本：约 100 μg 蛋白（具体根据蛋白分子量决定）
• •4-5 周交付结果
• •严格的数据隐私管理
• •专业的技术团队