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USP38 - ubiquitin specific peptidase 38 Gene

中文名称:泛素特异性肽酶 38

种属: Homo sapiens

同用名: HP43.8KD

基因 ID: 84640 | 基因类型: protein coding

关于 USP38

Cytogenetic location: 4q31.21 Genomic coordinates (GRCh38): 4:143,184,917-143,223,874 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 205 orthologues and 71 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 7.3), colon (RPKM 5.9) and 25 other tissues.

功能概要

启用硫醇依赖性去泛素化酶。参与蛋白质去泛素化。预计在胞质溶胶和细胞核中有活性。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables thiol-dependent Deubiquitinase. Involved in protein deubiquitination. Predicted to be active in cytosol and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

USP38 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001290325.1 NP_001277254.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 2
NM_001290326.1 NP_001277255.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 3
NM_001410848.1 NP_001397777.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 4
NM_032557.6 NP_115946.2 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables cysteine-type deubiquitinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
14715245 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32814053 GOA
enables protein sequestering activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
34102342 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of innate immune response IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
involved in negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
34102342 GOA
involved in protein K33-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

USP38 蛋白结构

UCH

UCH: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (445 - 946)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1042 a.a.
蛋白主名 其他名称

ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38

deubiquitinating enzyme 38

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris USP38 VGNC VGNC:48193
Macaca mulatta USP38 VGNC VGNC:79224
Felis catus USP38 VGNC VGNC:66884
Bos taurus USP38 VGNC VGNC:36727
Mus musculus USP38 MGD MGI:1922091
Rattus norvegicus USP38 RGD RGD:1311974