1. Gene
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GMEB1 - glucocorticoid modulatory element binding protein 1 Gene

中文名称:糖皮质激素调节元件结合蛋白 1

种属: Homo sapiens

同用名: PIF96; P96PIF

基因 ID: 10691 | 基因类型: protein coding

关于 GMEB1

Cytogenetic location: 1p35.3 Genomic coordinates (GRCh38): 1:28,668,229-28,719,353 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 250 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 4.0), testis (RPKM 3.2) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码与 GMEB2 蛋白相关的 KDWK 基因家族成员。 GMEB1-GMEB2 复合体对于细小病毒 DNA 复制至关重要。在大鼠中对类似基因的研究表明,该基因的作用是在糖皮质激素受体与糖皮质激素反应元件结合时调节其反式激活。存在三种编码不同亚型的可变剪接转录本变体。[RefSeq 提供,2016 年 2 月]

This gene encodes a member of KDWK gene family which associates with GMEB2 protein. The GMEB1-GMEB2 complex is essential for parvovirus DNA replication. Studies in rat for a similar gene suggest that this gene's role is to modulate the transactivation of the Glucocorticoid Receptor when it is bound to glucocorticoid response elements. Three alternative spliced transcript variants encoding different isoforms exist. [provided by RefSeq, Feb 2016]

GMEB1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001319674.2 NP_001306603.1 glucocorticoid modulatory element-binding protein 1 isoform 2
NM_006582.4 NP_006573.2 glucocorticoid modulatory element-binding protein 1 isoform 1
NM_024482.3 NP_077808.1 glucocorticoid modulatory element-binding protein 1 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables Hsp27 protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10386584 GOA
enables RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10386584 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10386584 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10894151 GOA
enables sequence-specific double-stranded DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
28473536 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
10386584 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

GMEB1 蛋白结构

SAND

SAND: SAND domain (88 - 166)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 573 a.a.
蛋白主名 其他名称

glucocorticoid modulatory element-binding protein 1

DNA-binding protein p96PIF

GMEB1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra GMEB1 Q9Y692 GMEB2 Homo sapiens Q9UKD1
Anti Tag CoIP
33961781
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus GMEB1 VGNC VGNC:29432
Canis familiaris GMEB1 VGNC VGNC:41286
Mus musculus GMEB1 MGD MGI:2135604
Felis catus GMEB1 VGNC VGNC:62605
Rattus norvegicus GMEB1 RGD RGD:1563208
Macaca mulatta GMEB1 VGNC VGNC:99963