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Scn10a - sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 Gene

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中文名称：钠电压门控通道 α 亚基 10

种属: Rattus norvegicus

同用名: PN3; Nav1.8; Na(V)1.8

基因 ID: 29571 | 基因类型: protein coding

关于 Scn10a

Primary_assembly 8: 119,350,724-119,462,614 reverse strand.mRatBN7.2:CM026981.1

This gene has 1 transcript (splice variant), 331 orthologues, 26 paralogues and is associated with 14 phenotypes. Biased expression in Heart (RPKM 8.7), Testes (RPKM 2.7) and 4 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动电压门控钠通道活动。参与含牙本质牙的牙发生；疼痛的感官知觉；和钠离子运输。位于轴突。是膜的组成部分。网格蛋白复合物的一部分。在谷氨酸能突触中活跃。是突触前膜的组成部分。用于研究坐骨神经病变。该基因的人类直向同源物与家族性发作性疼痛综合征 2 相关。与人类 SCN10A（钠电压门控通道 α 亚基 10）直向同源。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables voltage-gated Sodium Channel activity. Involved in odontogenesis of dentin-containing tooth; sensory perception of pain; and sodium ion transport. Located in axon. Is integral component of membrane. Part of clathrin complex. Is active in glutamatergic synapse. Is integral component of presynaptic membrane. Used to study sciatic neuropathy. Human ortholog(s) of this gene implicated in familial episodic pain syndrome 2. Orthologous to human SCN10A (sodium voltage-gated channel alpha subunit 10). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Scn10a 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017247.2 NP_058943.2 sodium channel protein type 10 subunit alpha
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12050667 RGD
enables voltage-gated monoatomic ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential IDA
IDA: 通过直接分析推断
26187311 RGD
enables voltage-gated monoatomic ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential IMP
IMP: 通过突变表型推断
26187311 RGD
enables voltage-gated sodium channel activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
8538791 RGD
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in odontogenesis of dentin-containing tooth IEP
IEP: 通过表达模式推断
21640979 RGD
involved in sodium ion transport IDA
IDA: 通过直接分析推断
8538791 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in axon IDA
IDA: 通过直接分析推断
21118538 RGD
part of clathrin complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15797711 RGD
is active in glutamatergic synapse IDA
IDA: 通过直接分析推断
19162133 RGD
is active in presynaptic membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
19162133 RGD
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

Scn10a 蛋白结构

Ion_trans

Ion_trans: pfam00520 (128 - 405)

Na_trans_cytopl

Na_trans_cytopl: cl13384 (486 - 613)

Ion_trans

Ion_trans: pfam00520 (662 - 892)

Na_trans_assoc

Na_trans_assoc: pfam06512 (902 - 1147)

Ion_trans

Ion_trans: pfam00520 (1151 - 1427)

Na_channel_gate

Na_channel_gate: cd13433 (1419 - 1471)

Ion_trans

Ion_trans: pfam00520 (1475 - 1732)

  • 0
  • 400
  • 800
  • 1200
  • 1600
  • 1956 a.a.
蛋白主名 其他名称

sodium channel protein type 10 subunit alpha

peripheral nerve sodium channel 3

sensory neuron sodium channel

sodium channel protein type X subunit alpha

sodium channel type X alpha polypeptide

sodium channel voltage-gated type X alpha polypeptide

sodium channel, voltage-gated, type 10, alpha polypeptide

sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit

voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.8

Scn10a 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
Scn10a Q62968 S100a10 Rattus norvegicus P05943
Y2H
12050667
种属内
Scn10a Q62968 Prx Rattus norvegicus Q63425
Y2H
12591166
种属内
Scn10a Q62968 Dynlt1 Rattus norvegicus Q9Z336
Anti Bait CoIP
12591166
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (3)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12519 SCN10A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS12520 Scn10a Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS12521 Scn10a Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Scn10a NCBI NCBI:6336
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