1. Gene
  2. ATG16L2 - autophagy related 16 like 2 Gene

ATG16L2 - autophagy related 16 like 2 Gene

中文名称:自噬相关 16 like 2

种属: Homo sapiens

同用名: WDR80; ATG16B

基因 ID: 89849 | 基因类型: protein coding

关于 ATG16L2

Cytogenetic location: 11q13.4 Genomic coordinates (GRCh38): 11:72,814,411-72,843,740 (from NCBI)

This gene has 21 transcripts (splice variants), 171 orthologues and 1 paralogue. Broad expression in spleen (RPKM 22.5), skin (RPKM 19.9) and 24 other tissues.

功能概要

预计参与自噬体组装和负链病毒 RNA 复制。位于核质中。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to be involved in autophagosome assembly and negative stranded viral RNA replication. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

ATG16L2 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001318766.2 NP_001305695.1 protein Atg16l2 isoform 2
NM_033388.2 NP_203746.1 protein Atg16l2 isoform 1
基因本体论
  • 细胞组分
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of Atg12-Atg5-Atg16 complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23202584 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

ATG16L2 蛋白结构

ATG16

ATG16: Autophagy protein 16 (ATG16) (14 - 204)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (331 - 364)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (414 - 450)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (503 - 530)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (554 - 576)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 619 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein Atg16l2

APG16-like 2

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris ATG16L2 VGNC VGNC:38220
Mus musculus ATG16L2 MGD MGI:1920933
Macaca mulatta ATG16L2 VGNC VGNC:70130
Rattus norvegicus ATG16L2 RGD RGD:1311400
Felis catus ATG16L2 VGNC VGNC:59999
Bos taurus ATG16L2 VGNC VGNC:26254