1. Gene
  2. UHRF2 - ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 Gene

UHRF2 - ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2 Gene

中文名称:含 PHD 和无名指结构域泛素样 2

种属: Homo sapiens

同用名: NIRF; URF2; RNF107; TDRD23

基因 ID: 115426 | 基因类型: protein coding

关于 UHRF2

Cytogenetic location: 9p24.1 Genomic coordinates (GRCh38): 9:6,413,199-6,507,054 (from NCBI)

This gene has 13 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 16.7), lymph node (RPKM 12.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码参与细胞周期调节的核蛋白。编码的蛋白质是一种泛素连接酶,能够泛素化 PCNP (含 PEST 的核蛋白) ,它们一起可能在肿瘤发生中发挥作用。编码的蛋白质包含一个 NIRF_N 结构域、一个 PHD 指、一个组和环相关 (SRA) 结构域以及一个 RING 指结构域,其中的几个结构域已被证明对细胞增殖的调节至关重要。这种蛋白质也可能在聚谷氨酰胺聚集体的核内降解中起作用。可变剪接导致多个转录变体,其中一些是非蛋白质编码。[RefSeq 提供,2012 年 2 月]

This gene encodes a nuclear protein which is involved in cell-cycle regulation. The encoded protein is a ubiquitin-ligase capable of ubiquinating PCNP (PEST-containing nuclear protein), and together they may play a role in tumorigenesis. The encoded protein contains an NIRF_N domain, a PHD finger, a set- and ring-associated (SRA) domain, and a RING finger domain and several of these domains have been shown to be essential for the regulation of cell proliferation. This protein may also have a role in intranuclear degradation of polyglutamine aggregates. Alternative splicing results in multiple transcript variants some of which are non-protein coding. [provided by RefSeq, Feb 2012]

UHRF2 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_152896.3 NP_690856.1 E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
27129234 GOA
enables SUMO transferase activity EXP
EXP: 通过实验结果推断
22467880 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12176013 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
14741369 GOA
enables ubiquitin-protein transferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
14741369 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in cell differentiation IEP
IEP: 通过表达模式推断
12176013 GOA
involved in protein autoubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
14741369 GOA
involved in protein ubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
14741369 GOA
involved in regulation of cell cycle IDA
IDA: 通过直接分析推断
15178429 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
12176013 GOA
located in pericentric heterochromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
27129234 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

UHRF2 蛋白结构

ubiquitin

ubiquitin: Ubiquitin family (7 - 75)

TTD

TTD: Tandem tudor domain within UHRF1 (178 - 261)

PHD

PHD: PHD-finger (347 - 394)

SAD_SRA

SAD_SRA: SAD/SRA domain (445 - 614)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 802 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2

Np95-like ring finger protein

UHRF2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCND1 Homo sapiens P24385
Anti Tag CoIP
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCND1 Homo sapiens P24385
Pull Down
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CDK2 Homo sapiens P24941
Protein Kinase Assay
15178429
种属内
UHRF2 Q96PU4 CDK2 Homo sapiens P24941
Anti Bait CoIP
15178429
种属内
UHRF2 Q96PU4 CDK2 Homo sapiens P24941
Pull Down
15178429
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCNA2 Homo sapiens P20248
Anti Tag CoIP
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 RB1 Homo sapiens P06400
Pull Down
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 RB1 Homo sapiens P06400
Antibody Array
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 RB1 Homo sapiens P06400
Anti Tag CoIP
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCNB1 Homo sapiens P14635
Anti Tag CoIP
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCNE1 Homo sapiens P24864
Pull Down
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCNE1 Homo sapiens P24864
Ubiquitinase Assay
21952639
种属内
UHRF2 Q96PU4 CCNE1 Homo sapiens P24864
Anti Tag CoIP
21952639
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus UHRF2 VGNC VGNC:54508
Canis familiaris UHRF2 VGNC VGNC:48126
Rattus norvegicus UHRF2 RGD RGD:1309990
Macaca mulatta UHRF2 VGNC VGNC:78714
Felis catus UHRF2 VGNC VGNC:66812
Mus musculus UHRF2 MGD MGI:1923718
Others UHRF2 NCBI