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RAB3C - RAB3C, member RAS oncogene family Gene

中文名称:RAB3C,RAS 致癌基因家族成员

种属: Homo sapiens

基因 ID: 115827 | 基因类型: protein coding

关于 RAB3C

Cytogenetic location: 5q11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 5:58,582,152-58,859,394 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 220 orthologues and 68 paralogues. Biased expression in brain (RPKM 24.5) and adrenal (RPKM 6.1).

功能概要

该基因是 Ras 致癌基因家族的成员,编码一种小 GTPase。其他类似的小 GTPases 已知参与囊泡运输,并且编码的蛋白质显示在将吞噬的 MHC 1 类复合物回收到细胞表面中发挥作用。已发现该基因的两个转录本变体编码不同的亚型。[RefSeq 提供,2015 年 12 月]

This gene is a member of the Ras oncogene family and encodes a small GTPase. Other similar small GTPases are known to be involved in vesicle trafficking, and the encoded protein was shown to play a role in recycling phagocytosed MHC class 1 complexes to the cell surface. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2015]

RAB3C 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001317915.2 NP_001304844.1 ras-related protein Rab-3C isoform 2
NM_138453.4 NP_612462.1 ras-related protein Rab-3C isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables GTPase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
24891604 GOA
enables myosin V binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24006491 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24891604 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in antigen processing and presentation IMP
IMP: 通过突变表型推断
19717423 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in perinuclear region of cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
19717423 GOA
located in vesicle IDA
IDA: 通过直接分析推断
19717423 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RAB3C 蛋白结构

Ras

Ras: Ras family (32 - 191)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 227 a.a.
蛋白主名 其他名称

ras-related protein Rab-3C

RAB3C 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RAB3C Q96E17 NEK7 Homo sapiens Q8TDX7 32814053
种属内
RAB3C Q96E17 NEK7 Homo sapiens Q8TDX7 32814053
种属内
RAB3C Q96E17 NEK7 Homo sapiens Q8TDX7 32814053
种属内
RAB3C Q96E17 VRTN Homo sapiens Q9H8Y1 32296183
种属内
RAB3C Q96E17 VRTN Homo sapiens Q9H8Y1 32296183
种属内
RAB3C Q96E17 VRTN Homo sapiens Q9H8Y1 32296183
种属内
RAB3C Q96E17 ITM2B Homo sapiens Q9Y287 32814053
种属内
RAB3C Q96E17 ITM2B Homo sapiens Q9Y287 32814053
种属内
RAB3C Q96E17 ITM2B Homo sapiens Q9Y287 32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Warburg Micro Syndrome 1

Warburg Micro Syndrome

Micro Syndrome

Warbm

WARBM1

Warburg Sjo Fledelius Syndrome

Warburg-Sjo-Fledelius Syndrome

Micro Syndrome 1

Microcephaly, Microcornea, Congenital Cataract, Intellectual Disability, Optic Atrophy And Hypogenitalism

Focal Epithelial Hyperplasia

Heck'S Disease

Heck Disease

Multifocal Epithelial Hyperplasia

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus RAB3C VGNC VGNC:97591
Rattus norvegicus RAB3C RGD RGD:620923
Mus musculus RAB3C MGD MGI:1914545
Canis familiaris RAB3C VGNC VGNC:45284
Bos taurus RAB3C VGNC VGNC:33651
Macaca mulatta RAB3C VGNC VGNC:81541