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PDCD11 - programmed cell death 11 Gene

中文名称:程序性细胞死亡 11

种属: Homo sapiens

同用名: ALG4; NFBP; RRP5; ALG-4

基因 ID: 22984 | 基因类型: protein coding

关于 PDCD11

Cytogenetic location: 10q24.33 Genomic coordinates (GRCh38): 10:103,396,626-103,446,294 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 204 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 12.3), skin (RPKM 7.7) and 25 other tissues.

功能概要

PDCD11 是一种 NF-kappa-B (NFKB1; 164011) 结合蛋白,与核仁中的 U3 RNA (MIM 180710) 共定位,是 rRNA 成熟和 18S rRNA 生成所必需的 (Sweet 等人,2003 [PubMed 14624448] ; Sweet 等人,2008 [PubMed 17654514]) .[OMIM 提供,2008 年 10 月]

PDCD11 is a NF-kappa-B (NFKB1; 164011)-binding protein that colocalizes with U3 RNA (MIM 180710) in the nucleolus and is required for rRNA maturation and generation of 18S rRNA (Sweet et al., 2003 [PubMed 14624448]; Sweet et al., 2008 [PubMed 17654514]).[supplied by OMIM, Oct 2008]

PDCD11 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001411058.1 NP_001397987.1 protein RRP5 homolog isoform 1
NM_014976.2 NP_055791.1 protein RRP5 homolog isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables NF-kappaB binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14624448 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14624448 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
14624448 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PDCD11 蛋白结构

S1

S1: S1 RNA binding domain (185 - 257)

S1

S1: S1 RNA binding domain (451 - 522)

S1

S1: S1 RNA binding domain (547 - 610)

S1

S1: S1 RNA binding domain (728 - 798)

S1

S1: S1 RNA binding domain (1035 - 1095)

Suf

Suf: Suppressor of forked protein (Suf) (1727 - 1868)

  • 0
  • 300
  • 600
  • 900
  • 1200
  • 1500
  • 1871 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein RRP5 homolog

NF-kappa-B-binding protein

PDCD11 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PDCD11 Q14690 NFKB1 Homo sapiens P19838 14624448
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Dentin Caries

Compound Dental Caries

Dental Caries Extending Into Dentine

Dental Caries Extending Into Dentin

Enamel Caries

Primary Dental Caries

Dental Caries Limited To Enamel

Simple Dental Cavity

Epididymo-Orchitis
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus PDCD11 MGD MGI:1341788
Macaca mulatta PDCD11 VGNC VGNC:75596
Bos taurus PDCD11 VGNC VGNC:32659
Canis familiaris PDCD11 VGNC VGNC:44335
Rattus norvegicus PDCD11 RGD RGD:1304933
Felis catus PDCD11 VGNC VGNC:64077