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  3. SHPRH - SNF2 histone linker PHD RING helicase Gene

SHPRH - SNF2 histone linker PHD RING helicase Gene

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中文名称：SNF2 组蛋白接头 PHD RING 解旋酶

种属: Homo sapiens

同用名: RAD5; bA545I5.2

基因 ID: 257218 | 基因类型: protein coding

关于 SHPRH

Cytogenetic location: 6q24.3 Genomic coordinates (GRCh38): 6:145,857,838-145,964,358 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 200 orthologues and 30 paralogues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 1.7), thyroid (RPKM 1.5) and 25 other tissues.

功能概要

SHPRH 是一种普遍表达的蛋白质，包含多种 DNA 修复蛋白、转录因子和解旋酶的基序特征。 SHPRH 是酿酒酵母 RAD5 的功能同系物 (Unk 等人，2006 [PubMed 17108083]) 。[OMIM 提供，2008 年 3 月]

SHPRH is a ubiquitously expressed protein that contains motifs characteristics of several DNA repair proteins, transcription factors, and helicases. SHPRH is a functional homolog of S. cerevisiae RAD5 (Unk et al., 2006 [PubMed 17108083]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

SHPRH 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001042683.3 NP_001036148.2 E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH isoform a
NM_001370327.1 NP_001357256.1 E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH isoform a
NM_001370328.1 NP_001357257.1 E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH isoform c
NM_173082.4 NP_775105.1 E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH isoform b
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17108083 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity EXP
EXP: 通过实验结果推断
17108083 GOA
enables ubiquitin protein ligase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
25023518 GOA
enables ubiquitin-protein transferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
17108083 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within DNA damage response IDA
IDA: 通过直接分析推断
25023518 GOA
involved in protein polyubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
17108083 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SHPRH 蛋白结构

SNF2_N

SNF2_N: SNF2 family N-terminal domain (307 - 987)

Linker_histone

Linker_histone: linker histone H1 and H5 family (440 - 512)

zf-C3HC4_2

zf-C3HC4_2: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (1432 - 1478)

  • 0
  • 300
  • 600
  • 900
  • 1200
  • 1500
  • 1683 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH

2610103K11Rik

SHPRH 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SHPRH Q149N8 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra SHPRH Q149N8 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Validated Y2H
25416956
Intra SHPRH Q149N8 EDARADD Homo sapiens Q8WWZ3
Validated Y2H
25416956
Intra SHPRH Q149N8 EDARADD Homo sapiens Q8WWZ3
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
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Xeroderma Pigmentosum

XPV

Xeroderma Pigmentosum Variant Type

Xeroderma Pigmentosum With Normal Dna Repair Rates

Photosensitivity With Defective Dna Synthesis

Xp

De Sanctis-Cacchione Syndrome

Desanctis-Cacchione Syndrome

Xeroderma Pigmentosa

Xerodermic Idiocy

Xeroderma Pigmentosum Variant

Xp - [Xeroderma Pigmentosum]

Atrophoderma Pigmentosum
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

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生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12882 SHPRH Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SHPRH RGD RGD:1310342
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Canis familiaris SHPRH VGNC VGNC:49029
Macaca mulatta SHPRH VGNC VGNC:77274
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