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SDF4 - stromal cell derived factor 4 Gene

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中文名称：基质细胞衍生因子 4

种属: Homo sapiens

同用名: Cab45; SDF-4

基因 ID: 51150 | 基因类型: protein coding

关于 SDF4

Cytogenetic location: 1p36.33 Genomic coordinates (GRCh38): 1:1,216,931-1,232,001 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 200 orthologues and 4 paralogues. Ubiquitous expression in colon (RPKM 31.3), kidney (RPKM 26.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种基质细胞衍生因子，它是 CREC 蛋白家族的一员。编码的蛋白质包含六个 EF 手基序和钙结合基序。这种蛋白质定位于高尔基体腔，可能参与调节钙依赖性细胞活动。[RefSeq 提供，2011 年 9 月]

This gene encodes a stromal cell derived factor that is a member of the CREC protein family. The encoded protein contains six EF-hand motifs and calcium-binding motifs. This protein localizes to the Golgi lumen and may be involved in regulating calcium dependent cellular activities. [provided by RefSeq, Sep 2011]

SDF4 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_016176.6 NP_057260.3 45 kDa calcium-binding protein isoform 2 precursor
NM_016547.3 NP_057631.2 45 kDa calcium-binding protein isoform 1 precursor
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables calcium ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
17442889 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17442889 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in maintenance of synapse structure IGI
IGI: 通过遗传相互作用推断
33667157 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SDF4 蛋白结构

EF-hand_7

EF-hand_7: EF-hand domain pair (103 - 163)

EF-hand_5

EF-hand_5: EF hand (287 - 305)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 362 a.a.
蛋白主名 其他名称

45 kDa calcium-binding protein

SDF4 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SDF4 Q9BRK5 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
Validated Y2H
32814053
种属内
SDF4 Q9BRK5 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
Y2H Array
32814053
种属内
SDF4 Q9BRK5 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
SDF4 Q9BRK5 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Validated Y2H
32814053
种属内
SDF4 Q9BRK5 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Array
32814053
种属内
SDF4 Q9BRK5 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Pooling
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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疾病名称 别名
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生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12589 SDF4 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SDF4 RGD RGD:621521
Bos taurus SDF4 VGNC VGNC:34387
Macaca mulatta SDF4 VGNC VGNC:77092
Felis catus SDF4 VGNC VGNC:64949
Mus musculus SDF4 MGD MGI:108079
Canis familiaris SDF4 VGNC VGNC:45948
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