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RTCB - RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase Gene

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中文名称：RNA 2',3'-环磷酸和 5'-OH 连接酶

种属: Homo sapiens

同用名: FAAP; HSPC117; C22orf28; DJ149A16.6

基因 ID: 51493 | 基因类型: protein coding

关于 RTCB

Cytogenetic location: 22q12.3 Genomic coordinates (GRCh38): 22:32,387,582-32,412,247 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants) and 210 orthologues. Ubiquitous expression in duodenum (RPKM 45.6), small intestine (RPKM 40.2) and 25 other tissues.

功能概要

启用 RNA 连接酶 (ATP) 活性和纽蛋白结合活性。通过核酸内切裂解和连接参与 tRNA 剪接。位于细胞质和核质中。 tRNA 剪接连接酶复合物的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables RNA Ligase (ATP) activity and vinculin binding activity. Involved in tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation. Located in cytosol and nucleoplasm. Part of tRNA-splicing Ligase complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RTCB 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_014306.5 NP_055121.1 RNA-splicing ligase RtcB homolog
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA ligase (GTP) activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21311021 GOA
enables RNA ligase (GTP) activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
24870230 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24608264 GOA
enables vinculin binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15163412 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation IDA
IDA: 通过直接分析推断
21311021 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
24608264 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
24608264 GOA
part of tRNA-splicing ligase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
21311021 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RTCB 蛋白结构

RtcB

RtcB: tRNA-splicing ligase RtcB (65 - 505)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 505 a.a.
蛋白主名 其他名称

RNA-splicing ligase RtcB homolog

3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase

RTCB 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RTCB Q9Y3I0 RTRAF Homo sapiens Q9Y224
TAP
24608264
种属内
RTCB Q9Y3I0 RTRAF Homo sapiens Q9Y224
Pull Down
30833792
种属内
RTCB Q9Y3I0 RTRAF Homo sapiens Q9Y224
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
RTCB Q9Y3I0 APPL1 Homo sapiens Q9UKG1
Y2H Array
25814554
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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疾病名称 别名
Oropharyngeal Anthrax
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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (2)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-145675A (R)-TCB2 / 否
HY-RS12316 RTCB Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus RTCB VGNC VGNC:34194
Macaca mulatta RTCB VGNC VGNC:77111
Mus musculus RTCB MGD MGI:106379
Felis catus RTCB VGNC VGNC:64805
Rattus norvegicus RTCB RGD RGD:1303261
Canis familiaris RTCB VGNC VGNC:49844
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