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PCF11 - PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit Gene

中文名称:PCF11 裂解和聚腺苷酸化因子亚基

种属: Homo sapiens

基因 ID: 51585 | 基因类型: protein coding

关于 PCF11

Cytogenetic location: 11q14.1 Genomic coordinates (GRCh38): 11:83,157,131-83,187,451 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants) and 212 orthologues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 13.1), spleen (RPKM 12.7) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质与 CLP1 结合形成 pre-mRNA 裂解因子 IIm。编码的蛋白质是有效的 Pol II 转录终止所必需的,并且可能参与 polyA 位点切割的 3' 产物的降解。[RefSeq 提供,2016 年 10 月]

The protein encoded by this gene binds to CLP1 to form pre-mRNA cleavage factor IIm. The encoded protein is necessary for efficient Pol II transcription termination and may be involved in degradation of the 3' product of polyA site cleavage. [provided by RefSeq, Oct 2016]

PCF11 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001346413.3 NP_001333342.1 pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 isoform 1
NM_001346414.2 NP_001333343.1 pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 isoform 2
NM_001346415.2 NP_001333344.1 pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 isoform 4
NM_015885.4 NP_056969.2 pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11 isoform 3
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
29196535 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
33961781 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in termination of RNA polymerase II transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
29196535 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
29196535 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PCF11 蛋白结构

CTD_bind

CTD_bind: RNA polymerase II-binding domain. (70 - 124)

  • 0
  • 300
  • 600
  • 900
  • 1200
  • 1555 a.a.
蛋白主名 其他名称

pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11

PCF11, cleavage and polyadenylation factor subunit, homolog

PCF11 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PCF11 O94913 CLP1 Homo sapiens Q92989 35177536
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Oculopharyngeal Muscular Dystrophy

OPMD

Muscular Dystrophy, Oculopharyngeal

Dystrophy, Oculopharyngeal Muscular

Oculopharyngeal Dystrophy

Progressive Muscular Dystrophy, Oculopharyngeal Type

Muscular Dystrophy Oculopharyngeal

Dystrophy, Muscular, Oculopharyngeal

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus PCF11 RGD RGD:1563397
Bos taurus PCF11 VGNC VGNC:32625
Canis familiaris PCF11 VGNC VGNC:44299
Mus musculus PCF11 MGD MGI:1919579
Macaca mulatta PCF11 VGNC VGNC:75701
Felis catus PCF11 VGNC VGNC:64065