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SLFN12 - schlafen family member 12 Gene

中文名称:施拉芬家族成员 12

种属: Homo sapiens

同用名: SLFN3

基因 ID: 55106 | 基因类型: protein coding

关于 SLFN12

Cytogenetic location: 17q12 Genomic coordinates (GRCh38): 17:35,410,922-35,433,174 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 101 orthologues and 6 paralogues. Ubiquitous expression in spleen (RPKM 3.5), urinary bladder (RPKM 3.0) and 24 other tissues.

功能概要

预计在细胞群增殖的负调节上游或负调节内起作用。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to act upstream of or within negative regulation of cell population proliferation. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SLFN12 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001289009.2 NP_001275938.1 ribonuclease SLFN12
NM_018042.5 NP_060512.3 ribonuclease SLFN12
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA nuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
34272366 GOA
enables RNA nuclease activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
35104454 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
31420216 GOA
enables ribosome binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
31420216 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in apoptotic signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
31420216 GOA
involved in rRNA catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
34272366 GOA
involved in rRNA catabolic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
35104454 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
35104454 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
35104454 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SLFN12 蛋白结构

AlbA_2

AlbA_2: Putative DNA-binding domain (200 - 326)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 578 a.a.
蛋白主名 其他名称

ribonuclease SLFN12

schlafen family member 12

SLFN12 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SLFN12 Q8IYM2 YARS1 Homo sapiens P54577
Y2H Array
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 YARS1 Homo sapiens P54577
Validated Y2H
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 YARS1 Homo sapiens P54577
Y2H Pooling
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Validated Y2H
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Y2H Array
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 SPRED1 Homo sapiens Q7Z699
Y2H Pooling
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 LPL Homo sapiens P06858
Y2H Array
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 LPL Homo sapiens P06858
Y2H Pooling
32814053
Intra SLFN12 Q8IYM2 LPL Homo sapiens P06858
Validated Y2H
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Bleeding Disorder, Platelet-Type, 20

Platelet-Type Bleeding Disorder 20

BDPLT20

Autosomal Dominant Thrombocytopenia With Platelet Secretion Defect

Monkeypox

Monkeypox Virus Infections

Progesterone-Receptor Positive Breast Cancer
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SLFN12 RGD RGD:620455