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GLYR1 - glyoxylate reductase 1 homolog Gene

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中文名称：乙醛酸还原酶 1 同系物

种属: Homo sapiens

同用名: NP60; NPAC; hNDF; BM045; HIBDL; N-PAC

基因 ID: 84656 | 基因类型: protein coding

关于 GLYR1

Cytogenetic location: 16p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 16:4,803,203-4,847,288 (from NCBI)

This gene has 13 transcripts (splice variants), 207 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 24.0), brain (RPKM 23.5) and 25 other tissues.

功能概要

启用 DNA 结合活性；甲基化组蛋白结合活性；和核小体结合活性。参与组蛋白乙酰化的正调控和 RNA 聚合酶 II 转录的正调控。位于细胞质和核质中。核小体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables DNA binding activity; methylated histone binding activity; and nucleosome binding activity. Involved in positive regulation of histone acetylation and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in cytosol and nucleoplasm. Part of nucleosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

GLYR1 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001308096.2 NP_001295025.1 cytokine-like nuclear factor N-PAC isoform 2
NM_001324096.2 NP_001311025.2 cytokine-like nuclear factor N-PAC isoform 3
NM_001324097.2 NP_001311026.2 cytokine-like nuclear factor N-PAC isoform 4
NM_001324098.2 NP_001311027.2 cytokine-like nuclear factor N-PAC isoform 5
NM_032569.4 NP_115958.2 cytokine-like nuclear factor N-PAC isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
29759984 GOA
enables chromatin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
29759984 GOA
enables chromatin-protein adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
30970244 GOA
enables histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
enables methylated histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20850016 GOA
enables nucleosome binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
29759984 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23260659 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in transcription elongation-coupled chromatin remodeling IDA
IDA: 通过直接分析推断
29759984 GOA
involved in transcription initiation-coupled chromatin remodeling IDA
IDA: 通过直接分析推断
30970244 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in chromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
30970244 GOA
part of nucleosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

GLYR1 蛋白结构

PWWP

PWWP: PWWP domain (7 - 88)

NAD_binding_2

NAD_binding_2: NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase (268 - 428)

NAD_binding_11

NAD_binding_11: NAD-binding of NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (431 - 551)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 553 a.a.
蛋白主名 其他名称

cytokine-like nuclear factor N-PAC

3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase-like protein

GLYR1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
GLYR1 Q49A26 CCNC Homo sapiens P24863
Validated Y2H
25416956
种属内
GLYR1 Q49A26 CCNC Homo sapiens P24863
Y2H Array
25416956
种属内
GLYR1 Q49A26 FHL2 Homo sapiens Q14192
Y2H Array
31515488
种属内
GLYR1 Q49A26 CFAP206 Homo sapiens Q8IYR0
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
GLYR1 Q49A26 CFAP206 Homo sapiens Q8IYR0
Y2H Array
25416956
种属内
GLYR1 Q49A26 EIF1AD Homo sapiens Q8N9N8
Y2H Array
31515488
种属内
GLYR1 Q49A26 EIF1AD Homo sapiens Q8N9N8
Y2H Array
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Retinitis Pigmentosa 47

RP47

Retinitis Pigmentosa, Type 47
Ritscher-Schinzel Syndrome

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疾病名称 别名
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HY-41700 D-Alanine 99.80% 否
HY-161246 uPSEM792 Agonist 99.92% 否
HY-41700S2 D-Alanine-d1 / 否
HY-RS05512 GLYR1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus GLYR1 VGNC VGNC:29430
Canis familiaris GLYR1 VGNC VGNC:41284
Macaca mulatta GLYR1 VGNC VGNC:99510
Rattus norvegicus GLYR1 RGD RGD:1309459
Mus musculus GLYR1 MGD MGI:1921272
Felis catus GLYR1 VGNC VGNC:62602
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