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TRIM15 - tripartite motif containing 15 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：含三方基序 15

种属: Homo sapiens

同用名: RNF93; ZNFB7; ZNF178

基因 ID: 89870 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM15

This gene has 4 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 79 orthologues and 80 paralogues. Biased expression in duodenum (RPKM 12.6), small intestine (RPKM 9.2) and 6 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是三联基序 (TRIM) 家族的成员。 TRIM 基序包括三个锌结合域、一个 RING、一个 B-box 类型 1 和一个 B-box 类型 2，以及一个卷曲螺旋区域。蛋白质定位于细胞质。已经描述了选择性剪接的转录本变体，但尚未确定它们的生物学有效性。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to the cytoplasm. Alternatively spliced transcript variants have been described, but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

TRIM15 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_033229.3 NP_150232.2 tripartite motif-containing protein 15
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables molecular sequestering activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
34871740 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
23077300 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in innate immune response IMP
IMP: 通过突变表型推断
18248090 GOA
involved in negative regulation of intracellular transport of viral material IMP
IMP: 通过突变表型推断
18248090 GOA
involved in negative regulation of non-canonical NF-kappaB signal transduction IDA
IDA: 通过直接分析推断
34871740 GOA
involved in positive regulation of DNA-binding transcription factor activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
23077300 GOA
involved in positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
23077300 GOA
involved in positive regulation of RIG-I signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
23077300 GOA
involved in positive regulation of type I interferon production IMP
IMP: 通过突变表型推断
23077300 GOA
involved in suppression of viral release by host IDA
IDA: 通过直接分析推断
18248090 GOA
involved in suppression of viral release by host IMP
IMP: 通过突变表型推断
18248090 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
34871740 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

TRIM15 蛋白结构

zf-C3HC4

zf-C3HC4: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (16 - 60)

zf-B_box

zf-B_box: B-box zinc finger (80 - 107)

  • 0
  • 100
  • 115 a.a.
蛋白主名 其他名称

tripartite motif-containing protein 15

RING finger protein 93

TRIM15 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TRIM15 Q9C019 FAM161A Homo sapiens Q3B820
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
TRIM15 Q9C019 FAM161A Homo sapiens Q3B820
Validated Y2H
25416956
种属内
TRIM15 Q9C019 FAM151B Homo sapiens Q6UXP7
Y2H Array
25416956
种属内
TRIM15 Q9C019 RABGEF1 Homo sapiens Q9UJ41
Y2H Array
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS15023 TRIM15 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TRIM15 VGNC VGNC:36316
Mus musculus TRIM15 MGD MGI:1916347
Macaca mulatta TRIM15 VGNC VGNC:83958
Rattus norvegicus TRIM15 RGD RGD:6496746
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