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CIR1 - corepressor interacting with RBPJ, CIR1 Gene

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中文名称：与 RBPJ、CIR1 相互作用的辅阻遏物

种属: Homo sapiens

同用名: CIR

基因 ID: 9541 | 基因类型: protein coding

关于 CIR1

Cytogenetic location: 2q31.1 Genomic coordinates (GRCh38): 2:174,348,022-174,395,712 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants) and 197 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 20.7), testis (RPKM 18.7) and 25 other tissues.

功能概要

启用组蛋白脱乙酰酶结合活性；蛋白激酶结合活性；和转录辅阻遏物活性。在 RNA 聚合酶 II 的转录负调节上游或负调节内起作用。位于核斑点。部分含蛋白质复合物。与中心体共定位。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables histone deacetylase binding activity; protein kinase binding activity; and transcription corepressor activity. Acts upstream of or within negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nuclear speck. Part of protein-containing complex. Colocalizes with centrosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

CIR1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_004882.4 NP_004873.3 corepressor interacting with RBPJ 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables histone deacetylase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9874765 GOA
enables protein kinase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20873783 GOA
enables protein-containing complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
enables transcription corepressor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within negative regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
acts upstream of or within negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
colocalizes with centrosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
20873783 GOA
located in nuclear speck IDA
IDA: 通过直接分析推断
15652350 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
9874765 GOA
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
20873783 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CIR1 蛋白结构

Cir_N

Cir_N: N-terminal domain of CBF1 interacting co-repressor CIR (13 - 49)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 450 a.a.
蛋白主名 其他名称

corepressor interacting with RBPJ 1

CBF1 (RBPJ) interacting corepressor 1

CIR1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CIR1 Q86X95 SRSF2 Homo sapiens Q01130
Anti Tag CoIP
15652350
种属内
CIR1 Q86X95 SRSF2 Homo sapiens Q01130
Y2H
15652350
种属内
CIR1 Q86X95 U2AF1 Homo sapiens Q01081
Y2H
15652350
种属内
CIR1 Q86X95 U2AF1 Homo sapiens Q01081
Pull Down
15652350
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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疾病名称 别名
Neurodermatitis
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生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS02720 CIR1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus CIR1 RGD RGD:1309199
Felis catus CIR1 VGNC VGNC:60907
Macaca mulatta CIR1 VGNC VGNC:71331
Mus musculus CIR1 MGD MGI:1914185
Bos taurus CIR1 VGNC VGNC:59328
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