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JADE3 - jade family PHD finger 3 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：翡翠家族 PHD 手指 3

种属: Homo sapiens

同用名: PHF16; JADE-3

基因 ID: 9767 | 基因类型: protein coding

关于 JADE3

Cytogenetic location: Xp11.3 Genomic coordinates (GRCh38): X:46,912,301-47,061,242 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 208 orthologues and 8 paralogues. Broad expression in testis (RPKM 8.9), placenta (RPKM 7.4) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码含有 PHD (植物同源结构域) 型锌指的大型蛋白质家族的成员。编码的蛋白质可能与在组蛋白 H4 乙酰化中起作用的核复合物相关联。可变剪接导致编码相同蛋白质的多个转录变体。[RefSeq 提供，2013 年 8 月]

This gene encodes a member of a family of large proteins containing PHD (plant homeo domain)-type zinc fingers. The encoded protein may be associated in a nuclear complex that functions in histone H4 acetylation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Aug 2013]

JADE3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001077445.3 NP_001070913.1 protein Jade-3
NM_014735.5 NP_055550.1 protein Jade-3
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in regulation of DNA biosynthetic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
16387653 GOA
involved in regulation of DNA replication IDA
IDA: 通过直接分析推断
16387653 GOA
involved in regulation of cell cycle IDA
IDA: 通过直接分析推断
16387653 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of histone acetyltransferase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
16387653 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
16387653 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

JADE3 蛋白结构

EPL1

EPL1: Enhancer of polycomb-like (37 - 177)

PHD_2

PHD_2: PHD-finger (215 - 247)

zf-HC5HC2H_2

zf-HC5HC2H_2: PHD-zinc-finger like domain (254 - 365)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 823 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein Jade-3

PHD finger protein 16

JADE3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra JADE3 Q92613 MAGEA11 Homo sapiens P43364-2
Validated Y2H
25416956
Intra JADE3 Q92613 MAGEA11 Homo sapiens P43364-2
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra JADE3 Q92613 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Y2H Pooling
32814053
Intra JADE3 Q92613 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Validated Y2H
32814053
Intra JADE3 Q92613 NDUFV2 Homo sapiens P19404
Y2H Array
32814053
Intra JADE3 Q92613 MAGEA11 Homo sapiens P43364
Y2H Array
32296183
Intra JADE3 Q92613 MAGEA11 Homo sapiens P43364
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra JADE3 Q92613 GFAP Homo sapiens P14136
Validated Y2H
32814053
Intra JADE3 Q92613 GFAP Homo sapiens P14136
Y2H Array
32814053
Intra JADE3 Q92613 GFAP Homo sapiens P14136
Y2H Pooling
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS07011 JADE3 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus JADE3 VGNC VGNC:62997
Macaca mulatta JADE3 VGNC VGNC:73640
Rattus norvegicus JADE3 RGD RGD:1563945
Canis familiaris JADE3 VGNC VGNC:42171
Bos taurus JADE3 VGNC VGNC:30360
Mus musculus JADE3 MGD MGI:2148019
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