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RNF144A - ring finger protein 144A Gene

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中文名称：无名指蛋白 144A

种属: Homo sapiens

同用名: UIP4; hUIP4; RNF144; UBCE7IP4

基因 ID: 9781 | 基因类型: protein coding

关于 RNF144A

Cytogenetic location: 2p25.1 Genomic coordinates (GRCh38): 2:6,917,412-7,076,367 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 202 orthologues and 9 paralogues. Ubiquitous expression in adrenal (RPKM 4.0), endometrium (RPKM 3.6) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码含有环指结构域的 E3 泛素连接酶家族的成员，该家族还包括 parkin 和 parc。该基因的表达是由 DNA 损伤引起的。编码的蛋白质与细胞质 DNA 依赖性蛋白激酶、催化亚基 (DNA-PKcs) 相互作用，并通过泛素化促进其降解。直系同源小鼠蛋白已被证明与参与胚胎发育的泛素结合酶相互作用。[RefSeq 提供，2017 年 3 月]

This gene encodes a member of a family of RING finger domain-containing E3 ubiquitin ligases that also includes parkin and parc. The expression of this gene is induced by DNA damage. The encoded protein interacts with the cytoplasmic DNA-dependent protein kinase, catalytic subunit (DNA-PKcs) and promotes its degradation through ubiquitination. The orthologous mouse protein has been shown to interact with a ubiquitin-conjugating Enzyme involved in embryonic development. [provided by RefSeq, Mar 2017]

RNF144A 基因产物(7)

mRNA Protein Name
NM_001349181.2 NP_001336110.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 1
NM_001349182.2 NP_001336111.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 2
NM_001349183.2 NP_001336112.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 2
NM_001349184.2 NP_001336113.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 2
NM_001349185.2 NP_001336114.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 3
NM_001349186.2 NP_001336115.1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 4
NM_014746.6 NP_055561.2 E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19549727 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity EXP
EXP: 通过实验结果推断
24979766 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
37955227 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in pattern recognition receptor signaling pathway IDA
IDA: 通过直接分析推断
37955227 GOA
involved in protein K6-linked ubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
37955227 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in Golgi apparatus IDA
IDA: 通过直接分析推断
10942595 GOA
is active in endoplasmic reticulum membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
37955227 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RNF144A 蛋白结构

IBR

IBR: IBR domain, a half RING-finger domain (91 - 156)

IBR

IBR: IBR domain, a half RING-finger domain (177 - 217)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 292 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A

UbcM4-interacting protein 4

RNF144A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RNF144A P50876 DGAT2L6 Homo sapiens Q6ZPD8
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 PAQR6 Homo sapiens Q6TCH4
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 MFSD5 Homo sapiens Q6N075
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 RFT1 Homo sapiens Q96AA3
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 RFT1 Homo sapiens Q96AA3
Y2H Array
32296183
Intra RNF144A P50876 CKAP4 Homo sapiens Q07065
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNF144A P50876 CKAP4 Homo sapiens Q07065
Anti Tag CoIP
28514442
Intra RNF144A P50876 UBE2L3 Homo sapiens P68036
Y2H Array
19549727
Intra RNF144A P50876 UBE2L3 Homo sapiens P68036
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 SGTB Homo sapiens Q96EQ0
Validated Y2H
32296183
Intra RNF144A P50876 SEC22A Homo sapiens Q96IW7
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12053 RNF144A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris RNF144A VGNC VGNC:45635
Felis catus RNF144A VGNC VGNC:64673
Rattus norvegicus RNF144A RGD RGD:1561737
Bos taurus RNF144A VGNC VGNC:34026
Macaca mulatta RNF144A VGNC VGNC:106212
Mus musculus RNF144A MGD MGI:1344401
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