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TRIM10 - tripartite motif containing 10 Gene

中文名称:含三方基序 10

种属: Homo sapiens

同用名: RNF9; HERF1; RFB30

基因 ID: 10107 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM10

Cytogenetic location: 6p22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 6:30,151,943-30,164,009 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 96 orthologues and 80 paralogues. Biased expression in bone marrow (RPKM 6.5), kidney (RPKM 1.8) and 6 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是三联基序 (TRIM) 家族的成员。 TRIM 基序包括三个锌结合域、一个 RING、一个 B-box 类型 1 和一个 B-box 类型 2,以及一个卷曲螺旋区域。该蛋白质定位于细胞质体。对小鼠的研究表明,这种蛋白质在红细胞的终末分化中发挥作用。该基因的交替剪接产生两种编码不同亚型的转录本变体。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein localizes to cytoplasmic bodies. Studies in mice suggest that this protein plays a role in terminal differentiation of erythroid cells. Alternate splicing of this gene generates two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

TRIM10 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_006778.4 NP_006769.2 tripartite motif-containing protein 10 isoform 1
NM_052828.3 NP_439893.2 tripartite motif-containing protein 10 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TRIM10 蛋白结构

zf-C3HC4_4

zf-C3HC4_4: zinc finger of C3HC4-type, RING (16 - 60)

zf-B_box

zf-B_box: B-box zinc finger (95 - 132)

PRY

PRY: SPRY-associated domain (313 - 359)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 395 a.a.
蛋白主名 其他名称

tripartite motif-containing protein 10

B30-RING finger protein

TRIM10 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TRIM10 Q9UDY6 ZNF148 Homo sapiens Q9UQR1 25416956
种属内
TRIM10 Q9UDY6 ZNF148 Homo sapiens Q9UQR1 25416956
种属内
TRIM10 Q9UDY6 PSMA1 Homo sapiens P25786 25416956
种属内
TRIM10 Q9UDY6 PSMA1 Homo sapiens P25786 25416956
种属内
TRIM10 Q9UDY6 PSMA1 Homo sapiens P25786 25416956
种属内
TRIM10 Q9UDY6 TTC23 Homo sapiens Q5W5X9 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus TRIM10 MGD MGI:1338757
Canis familiaris TRIM10 VGNC VGNC:49639
Rattus norvegicus TRIM10 RGD RGD:1359438
Bos taurus TRIM10 VGNC VGNC:36312
Macaca mulatta TRIM10 VGNC VGNC:78550