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TAF6L - TATA-box binding protein associated factor 6 like Gene

中文名称:TATA 盒结合蛋白相关因子 6 样

种属: Homo sapiens

同用名: PAF65A

基因 ID: 10629 | 基因类型: protein coding

关于 TAF6L

Cytogenetic location: 11q12.3 Genomic coordinates (GRCh38): 11:62,771,396-62,787,342 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 187 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 7.9), fat (RPKM 5.1) and 25 other tissues.

功能概要

RNA 聚合酶 II 启动转录需要 70 多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是转录因子 IID (TFIID) ,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装转录复合物其余部分的支架,并充当调节信号的通道。 TFIID 由 TATA 结合蛋白 (TBP) 和一组称为 TBP 相关因子或 TAF 的进化保守蛋白组成。 TAF 可能参与基础转录,充当共激活因子,在启动子识别中发挥作用或修饰一般转录因子 (GTF) 以促进复杂的组装和转录起始。该基因编码的蛋白质是 PCAF 组蛋白乙酰化酶复合物的一个组成部分,在结构上类似于一种组蛋白样 TAF,TAF6。 PCAF 组蛋白乙酰化酶复合物由 20 多种多肽组成,其中一些是 TAF,是肌源性转录和分化所必需的。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

Initiation of transcription by RNA polymerase II requires the activities of more than 70 polypeptides. The protein that coordinates these activities is transcription factor IID (TFIID), which binds to the core promoter to position the polymerase properly, serves as the scaffold for assembly of the remainder of the transcription complex, and acts as a channel for regulatory signals. TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and a group of evolutionarily conserved proteins known as TBP-associated factors or TAFs. TAFs may participate in basal transcription, serve as coactivators, function in promoter recognition or modify general transcription factors (GTFs) to facilitate complex assembly and transcription initiation. This gene encodes a protein that is a component of the PCAF histone acetylase complex and structurally similar to one of the histone-like TAFs, TAF6. The PCAF histone acetylase complex, which is composed of more than 20 polypeptides some of which are TAFs, is required for myogenic transcription and differentiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

TAF6L 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006473.4 NP_006464.1 TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9674425 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
11564863 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of SAGA complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
11564863 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11564863 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TAF6L 蛋白结构

TAF

TAF: TATA box binding protein associated factor (TAF) (10 - 73)

TAF6_C

TAF6_C: TAF6 C-terminal HEAT repeat domain (242 - 333)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 622 a.a.
蛋白主名 其他名称

TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L

PAF65-alpha

TAF6L 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TAF6L Q9Y6J9 PFDN5 Homo sapiens Q99471 32296183
种属内
TAF6L Q9Y6J9 PFDN5 Homo sapiens Q99471 32296183
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 16713569
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 25416956
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 32296183
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 32296183
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 25416956
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 9674425
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9 Homo sapiens Q16594 33961781
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9B Homo sapiens Q9HBM6 28514442
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9B Homo sapiens Q9HBM6 32296183
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9B Homo sapiens Q9HBM6 33961781
种属内
TAF6L Q9Y6J9 TAF9B Homo sapiens Q9HBM6 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus TAF6L VGNC VGNC:65936
Bos taurus TAF6L VGNC VGNC:35578
Canis familiaris TAF6L VGNC VGNC:47086
Mus musculus TAF6L MGD MGI:2444957
Macaca mulatta TAF6L VGNC VGNC:78149
Rattus norvegicus TAF6L RGD RGD:1310123