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TAF9 - TATA-box binding protein associated factor 9 Gene

中文名称:TATA-box 结合蛋白相关因子 9

种属: Homo sapiens

同用名: TAF2G; TAFII31; TAFII32; MGC:5067; TAFII-31; TAFII-32; TAFIID32; STAF31/32

基因 ID: 6880 | 基因类型: protein coding

关于 TAF9

Cytogenetic location: 5q13.2 Genomic coordinates (GRCh38): 5:69,364,743-69,369,824 (from NCBI)

This gene has 20 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 204 orthologues and 1 paralogue. Broad expression in testis (RPKM 60.1), bone marrow (RPKM 34.1) and 25 other tissues.

功能概要

RNA 聚合酶 II 启动转录需要 70 多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是转录因子 IID (TFIID) ,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装转录复合物其余部分的支架,并充当调节信号的通道。 TFIID 由 TATA 结合蛋白 (TBP) 和一组称为 TBP 相关因子或 TAF 的进化保守蛋白组成。 TAF 可能参与基础转录,充当共激活因子,在启动子识别中发挥作用或修饰一般转录因子 (GTF) 以促进复杂的组装和转录起始。该基因编码 TFIID 的一个较小亚基,该亚基与基础转录因子 GTF2B 以及 p53 和 VP16 等几种转录激活因子结合。在人类中,TAF9 和 AK6 (GeneID:102157402) 是两个共享 5' 外显子的不同基因。在 X 染色体上发现了一个相似但不同的基因 (TAF9L) ,并在 19 号染色体上发现了一个假基因。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2013 年 9 月]

Initiation of transcription by RNA polymerase II requires the activities of more than 70 polypeptides. The protein that coordinates these activities is transcription factor IID (TFIID), which binds to the core promoter to position the polymerase properly, serves as the scaffold for assembly of the remainder of the transcription complex, and acts as a channel for regulatory signals. TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and a group of evolutionarily conserved proteins known as TBP-associated factors or TAFs. TAFs may participate in basal transcription, serve as coactivators, function in promoter recognition or modify general transcription factors (GTFs) to facilitate complex assembly and transcription initiation. This gene encodes one of the smaller subunits of TFIID that binds to the basal transcription factor GTF2B as well as to several transcriptional activators such as p53 and VP16. In human, TAF9 and AK6 (GeneID: 102157402) are two distinct genes that share 5' exons. A similar but distinct gene (TAF9L) has been found on the X chromosome and a pseudogene has been identified on chromosome 19. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

TAF9 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001015892.2 NP_001015892.1 transcription initiation factor TFIID subunit 9
NM_003187.5 NP_003178.1 transcription initiation factor TFIID subunit 9
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables ATPase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17636026 GOA
enables C2H2 zinc finger domain binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19251649 GOA
enables DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15601843 GOA
enables DNA-binding transcription factor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9171108 GOA
contributes to histone acetyltransferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
9674425 GOA
enables p53 binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11278372 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7667268 GOA
enables transcription cis-regulatory region binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
19251649 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
11564863 GOA
enables transcription coactivator activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
11278372 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of MLL1 complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15960975 GOA
part of SAGA complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9674425 GOA
located in nucleus EXP
EXP: 通过实验结果推断
23332750 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11564863 GOA
part of pre-snoRNP complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
17636026 GOA
part of transcription factor TFIID complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
14580349 GOA
part of transcription factor TFIID complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23332750 GOA
part of transcription factor TFTC complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15899866 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TAF9 蛋白结构

TFIID-31kDa

TFIID-31kDa: Transcription initiation factor IID, 31kD subunit (2 - 130)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 264 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription initiation factor TFIID subunit 9

RNA polymerase II TBP-associated factor subunit G

TAF9 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
TAF9 Q16594 Klf1 Mus musculus P46099
Anti Bait CoIP
19251649
种属内
TAF9 Q16594 KPNA1 Homo sapiens P52294
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
TAF9 Q16594 KPNA1 Homo sapiens P52294
Validated Y2H
25416956
种属内
TAF9 Q16594 KPNA1 Homo sapiens P52294
Y2H Array
16713569
种属内
TAF9 Q16594 KPNA1 Homo sapiens P52294
Y2H Array
25416956
种属内
TAF9 Q16594 KPNA6 Homo sapiens O60684
Y2H Array
16713569
种属内
TAF9 Q16594 KPNA6 Homo sapiens O60684
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TAF9 Q16594 KPNA6 Homo sapiens O60684
Y2H Array
32296183
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H Array
32296183
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H
21516116
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H Pooling
16189514
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Validated Y2H
25416956
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H Array
16713569
种属内
TAF9 Q16594 DRAP1 Homo sapiens Q14919
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TAF9 Q16594 TAF6L Homo sapiens Q9Y6J9
Validated Y2H
32296183
种属内
TAF9 Q16594 TAF6L Homo sapiens Q9Y6J9
Validated Y2H
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus TAF9 RGD RGD:727861
Mus musculus TAF9 MGD MGI:1888697
Canis familiaris TAF9 VGNC VGNC:47090
Bos taurus TAF9 VGNC VGNC:35582