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USP39 - ubiquitin specific peptidase 39 Gene

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中文名称：泛素特异性肽酶 39

种属: Homo sapiens

同用名: 65K; SAD1; CGI-21; HSPC332; SNRNP65

基因 ID: 10713 | 基因类型: protein coding

关于 USP39

Cytogenetic location: 2p11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 2:85,602,861-85,649,283 (from NCBI)

This gene has 20 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 14.6), placenta (RPKM 13.8) and 25 other tissues.

功能概要

预测可启用硫醇依赖性去泛素化酶和锌离子结合活性。参与剪接体复合体组装。位于核质中。 U4/U6 x U5 tri-snRNP 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable thiol-dependent Deubiquitinase and zinc ion binding activity. Involved in spliceosomal complex assembly. Located in nucleoplasm. Part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

USP39 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001256725.2 NP_001243654.1 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 isoform 1
NM_001256726.2 NP_001243655.1 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 isoform 2
NM_001256727.2 NP_001243656.1 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 isoform 3
NM_001256728.2 NP_001243657.1 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 isoform 4
NM_006590.4 NP_006581.2 U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
NOT enables cysteine-type deubiquitinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
18728397 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23602568 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
11350945 GOA
involved in spliceosomal complex assembly IMP
IMP: 通过突变表型推断
11350945 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
11350945 GOA
part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
30975767 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11350945 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

USP39 蛋白结构

zf-UBP

zf-UBP: Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein (129 - 185)

UCH

UCH: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (225 - 550)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 565 a.a.
蛋白主名 其他名称

U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2

SAD1 homolog

USP39 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
USP39 Q53GS9 LRRK2 Homo sapiens Q5S007
Protein Array
29513927
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS15550 USP39 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus USP39 RGD RGD:1308103
Bos taurus USP39 VGNC VGNC:36728
Mus musculus USP39 MGD MGI:107622
Canis familiaris USP39 VGNC VGNC:48194
Macaca mulatta USP39 VGNC VGNC:79227
Felis catus USP39 VGNC VGNC:66885
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