1. Gene
  2. Casp4 - caspase 4 Gene

Casp4 - caspase 4 Gene

中文名称:半胱天冬酶 4

种属: Rattus norvegicus

同用名: Casp11

基因 ID: 114555 | 基因类型: protein coding

关于 Casp4

Primary_assembly 8: 2,598,876-2,635,092 forward strand.mRatBN7.2:CM026981.1

This gene has 1 transcript (splice variant), 252 orthologues, 12 paralogues and is associated with 5 phenotypes. Biased expression in Spleen (RPKM 162.6), Thymus (RPKM 161.5) and 9 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动支架蛋白结合活性。预计参与多个过程,包括对淀粉样蛋白-β 的细胞反应;肿瘤坏死因子介导的信号通路的正向调控;和蛋白质自动加工。预计在异位生殖细胞程序性细胞死亡的上游或内部起作用;白细胞介素 1 β 生成的正向调节;和细胞焦亡。位于神经元投射区和神经元细胞体中。部分含蛋白质复合物。与人类 CASP4(caspase 4)同源。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables scaffold protein binding activity. Predicted to be involved in several processes, including cellular response to amyloid-beta; positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; and protein autoprocessing. Predicted to act upstream of or within ectopic germ cell programmed cell death; positive regulation of interleukin-1 beta production; and Pyroptosis. Located in neuron projection and neuronal cell body. Part of protein-containing complex. Orthologous to human CASP4 (Caspase 4). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Casp4 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_053736.2 NP_446188.2 caspase 4
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19416975 RGD
enables scaffold protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19416975 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in neuronal cell body IDA
IDA: 通过直接分析推断
19401709 RGD
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19416975 RGD
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

Casp4 蛋白结构

CARD_CASP1-like

CARD_CASP1-like: cd08325 (4 - 84)

CASc

CASc: smart00115 (121 - 370)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 373 a.a.
蛋白主名 其他名称

caspase 4

caspase 11

caspase 4, apoptosis-related cysteine peptidase

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Casp4 NCBI NCBI:837