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ARID3A - AT-rich interaction domain 3A Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：AT-rich 交互域 3A

种属: Homo sapiens

同用名: DRIL1; DRIL3; BRIGHT; E2FBP1

基因 ID: 1820 | 基因类型: protein coding

关于 ARID3A

Cytogenetic location: 19p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 19:925,732-975,939 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 191 orthologues and 2 paralogues. Broad expression in placenta (RPKM 13.1), bone marrow (RPKM 2.3) and 16 other tissues.

功能概要

该基因编码 DNA 结合蛋白 ARID (富含 AT 相互作用域) 家族的成员。它是通过与果蝇 dead ringer 基因的同源性发现的，该基因对正常的胚胎发生很重要。其他 ARID 家族成员在胚胎模式、细胞谱系基因调控、细胞周期控制、转录调控以及可能在染色质结构修饰中发挥作用。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the ARID (AT-rich interaction domain) family of DNA binding proteins. It was found by homology to the Drosophila dead ringer gene, which is important for normal embryogenesis. Other ARID family members have roles in embryonic patterning, cell lineage gene regulation, cell cycle control, transcriptional regulation, and possibly in chromatin structure modification. [provided by RefSeq, Jul 2008]

ARID3A 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005224.3 NP_005215.1 AT-rich interactive domain-containing protein 3A
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19214191 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in membrane raft IDA
IDA: 通过直接分析推断
21955986 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

ARID3A 蛋白结构

ARID

ARID: ARID/BRIGHT DNA binding domain (238 - 326)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 593 a.a.
蛋白主名 其他名称

AT-rich interactive domain-containing protein 3A

ARID domain-containing 3A

ARID3A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra ARID3A Q99856 MORF4L1 Homo sapiens Q9UBU8-2
Validated Y2H
32296183
Intra ARID3A Q99856 REP15 Homo sapiens Q6BDI9
Y2H Array
32296183
Intra ARID3A Q99856 REP15 Homo sapiens Q6BDI9
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra ARID3A Q99856 ANKRD11 Homo sapiens X5D778
Validated Y2H
32296183
Intra ARID3A Q99856 BTK Homo sapiens Q06187
Anti Bait CoIP
19214191
Intra ARID3A Q99856 BTK Homo sapiens Q06187
Density Sedimentation
19214191
Intra ARID3A Q99856 NOTCH2NLA Homo sapiens Q7Z3S9
Y2H Array
25416956
Intra ARID3A Q99856 KRT31 Homo sapiens Q15323
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra ARID3A Q99856 KRT31 Homo sapiens Q15323
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS00969 ARID3A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta ARID3A VGNC VGNC:69930
Bos taurus ARID3A VGNC VGNC:26126
Canis familiaris ARID3A VGNC VGNC:38095
Mus musculus ARID3A MGD MGI:1328360
Rattus norvegicus ARID3A RGD RGD:1305299
Felis catus ARID3A VGNC VGNC:59914
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