1. Gene
  2. FGD2 - FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 Gene

FGD2 - FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 Gene

中文名称:含 FYVE、RhoGEF 和 PH 域 2

种属: Homo sapiens

同用名: ZFYVE4

基因 ID: 221472 | 基因类型: protein coding

关于 FGD2

Cytogenetic location: 6p21.2 Genomic coordinates (GRCh38): 6:37,005,655-37,029,069 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 135 orthologues and 10 paralogues. Biased expression in spleen (RPKM 19.9), lymph node (RPKM 9.1) and 13 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质属于鸟嘌呤核苷酸交换因子 (GEF) 家族,它通过激活细胞分裂周期 42 (CDC42) 蛋白质来控制细胞骨架依赖性膜重排。该基因在 B 淋巴细胞、巨噬细胞和树突状细胞中表达。编码的蛋白质可能在免疫系统中抗原呈递细胞的白细胞信号传导和囊泡运输中发挥作用。[RefSeq 提供,2016 年 10 月]

The protein encoded by this gene belongs to a family of guanine nucleotide exchange factors (GEFs) which control cytoskeleton-dependent membrane rearrangements by activating the cell division cycle 42 (CDC42) protein. This gene is expressed in B lymphocytes, macrophages, and dendritic cells. The encoded protein may play a role in leukocyte signaling and vesicle trafficking in antigen-presenting cells in the immune system. [provided by RefSeq, Oct 2016]

FGD2 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_173558.4 NP_775829.2 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

FGD2 蛋白结构

RhoGEF

RhoGEF: RhoGEF domain (106 - 288)

PH

PH: PH domain (322 - 417)

FYVE

FYVE: FYVE zinc finger (453 - 516)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 655 a.a.
蛋白主名 其他名称

FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 2

FGD1 family, member 2

FGD2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
FGD2 Q7Z6J4 RPRM Homo sapiens Q9NS64 32296183
种属内
FGD2 Q7Z6J4 RPRM Homo sapiens Q9NS64 32296183
种属内
FGD2 Q7Z6J4 RPRM Homo sapiens Q9NS64 32296183
种属内
FGD2 Q7Z6J4 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 25416956
种属内
FGD2 Q7Z6J4 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 25416956
种属内
FGD2 Q7Z6J4 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 25416956
种属内
FGD2 Q7Z6J4 PLEKHG4 Homo sapiens Q58EX7 32296183
种属内
FGD2 Q7Z6J4 PLEKHG4 Homo sapiens Q58EX7 32296183
种属内
FGD2 Q7Z6J4 TMEM239 Homo sapiens Q8WW34 25416956
种属内
FGD2 Q7Z6J4 TMEM239 Homo sapiens Q8WW34 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus FGD2 MGD MGI:1347084
Bos taurus FGD2 VGNC VGNC:28965
Macaca mulatta FGD2 VGNC VGNC:72643
Felis catus FGD2 VGNC VGNC:62240
Canis familiaris FGD2 VGNC VGNC:40834
Rattus norvegicus FGD2 RGD RGD:1309840