2. Gene
  3. CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 Gene

CPEB3 - cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：细胞质聚腺苷酸化元件结合蛋白 3

种属: Homo sapiens

基因 ID: 22849 | 基因类型: protein coding

关于 CPEB3

Cytogenetic location: 10q23.32 Genomic coordinates (GRCh38): 10:92,046,692-92,291,233 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 201 orthologues, 3 paralogues and is associated with 68 phenotypes. Broad expression in brain (RPKM 4.8), liver (RPKM 4.1) and 25 other tissues.

功能概要

启用 mRNA 3'-UTR 结合活性和翻译因子活性，RNA 结合。参与细胞对氨基酸刺激的反应； RNA 聚合酶 II 对转录的负调控；和 mRNA 分解代谢过程的正调控。位于几种细胞成分中，包括细胞质；中体;和核质。 CCR4-NOT 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables mRNA 3'-UTR binding activity and translation factor activity, RNA binding. Involved in cellular response to amino acid stimulus; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; and positive regulation of mRNA catabolic process. Located in several cellular components, including cytosol; midbody; and nucleoplasm. Part of CCR4-NOT complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

CPEB3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001178137.2 NP_001171608.1 cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3 isoform 2
NM_014912.5 NP_055727.3 cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22730302 GOA
enables mRNA 3'-UTR binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22711986 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20639532 GOA
enables translation factor activity, RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22711986 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in 3'-UTR-mediated mRNA destabilization IDA
IDA: 通过直接分析推断
21336257 GOA
involved in cellular response to amino acid stimulus IDA
IDA: 通过直接分析推断
20639532 GOA
involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
20639532 GOA
involved in negative regulation of translation IDA
IDA: 通过直接分析推断
22711986 GOA
involved in positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay IDA
IDA: 通过直接分析推断
21336257 GOA
involved in positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening IDA
IDA: 通过直接分析推断
21336257 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of CCR4-NOT complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
21336257 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
20639532 GOA
located in neuron projection IDA
IDA: 通过直接分析推断
22730302 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
20639532 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CPEB3 蛋白结构

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (443 - 504)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 698 a.a.
蛋白主名 其他名称

cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3

CPE-BP3

CPEB3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra CPEB3 Q8NE35 TOB1 Homo sapiens P50616
Anti Tag CoIP
21336257
Intra CPEB3 Q8NE35 TOB1 Homo sapiens P50616
Pull Down
21336257
Intra CPEB3 Q8NE35 TOB1 Homo sapiens P50616
Anti Bait CoIP
21336257
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS03093 CPEB3 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta CPEB3 VGNC VGNC:71449
Mus musculus CPEB3 MGD MGI:2443075
Canis familiaris CPEB3 VGNC VGNC:39553
Bos taurus CPEB3 VGNC VGNC:27649
Rattus norvegicus CPEB3 RGD RGD:1564670
Others CPEB3 NCBI
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