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KAZN - kazrin, periplakin interacting protein Gene

中文名称:kazrin,periplakin 相互作用蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: KAZ; C1orf196

基因 ID: 23254 | 基因类型: protein coding

关于 KAZN

Cytogenetic location: 1p36.21 Genomic coordinates (GRCh38): 1:13,892,824-15,118,043 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants) and 310 orthologues. Broad expression in spleen (RPKM 16.3), brain (RPKM 5.1) and 17 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质在桥粒组装、细胞粘附、细胞骨架组织和表皮分化中发挥作用。该蛋白与桥粒蛋白和细胞连接蛋白 periplakin 共定位。一般来说,这种蛋白质定位于细胞核、桥粒、细胞膜和基于皮质肌动蛋白的结构。这种蛋白质的一些亚型也与微管相关。可变剪接导致编码不同异构体的多个转录变体。已描述了其他剪接变体,但尚未验证其生物学有效性。[RefSeq 提供,2011 年 8 月]

This gene encodes a protein that plays a role in desmosome assembly, cell adhesion, cytoskeletal organization, and epidermal differentiation. This protein co-localizes with desmoplakin and the cytolinker protein periplakin. In general, this protein localizes to the nucleus, desmosomes, cell membrane, and cortical actin-based structures. Some isoforms of this protein also associate with microtubules. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Additional splice variants have been described but their biological validity has not been verified. [provided by RefSeq, Aug 2011]

KAZN 基因产物(8)

mRNA Protein Name
NM_001017999.3 NP_001017999.1 kazrin isoform C
NM_001018000.4 NP_001018000.1 kazrin isoform B
NM_001018001.3 NP_001018001.1 kazrin isoform C
NM_001370229.1 NP_001357158.1 kazrin isoform F
NM_001370230.1 NP_001357159.1 kazrin isoform G
NM_001370231.1 NP_001357160.1 kazrin isoform H
NM_015209.2 NP_056024.1 kazrin isoform A
NM_201628.3 NP_963922.2 kazrin isoform E
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21653829 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cornified envelope IDA
IDA: 通过直接分析推断
15337775 GOA
located in desmosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
15337775 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

KAZN 蛋白结构

SAM_1

SAM_1: SAM domain (Sterile alpha motif) (444 - 508)

SAM_1

SAM_1: SAM domain (Sterile alpha motif) (530 - 583)

SAM_2

SAM_2: SAM domain (Sterile alpha motif) (609 - 666)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 775 a.a.
蛋白主名 其他名称

kazrin

KAZN 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
KAZN Q674X7 TSC1 Homo sapiens Q92574 21653829
种属内
KAZN Q674X7 TSC1 Homo sapiens Q92574 21653829
种属内
KAZN Q674X7 FXR1 Homo sapiens P51114 21653829
种属内
KAZN Q674X7 FXR1 Homo sapiens P51114 21653829
种属内
KAZN Q674X7 LZTS2 Homo sapiens Q9BRK4 25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus KAZN MGD MGI:1918779
Felis catus KAZN VGNC VGNC:107568
Bos taurus KAZN VGNC VGNC:30411
Rattus norvegicus KAZN RGD RGD:1359147
Canis familiaris KAZN VGNC VGNC:42221
Macaca mulatta KAZN VGNC VGNC:73932