2. Gene
  3. MKRN2 - makorin ring finger protein 2 Gene

MKRN2 - makorin ring finger protein 2 Gene

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中文名称：makorin 无名指蛋白 2

种属: Homo sapiens

同用名: RNF62; HSPC070

基因 ID: 23609 | 基因类型: protein coding

关于 MKRN2

Cytogenetic location: 3p25.2 Genomic coordinates (GRCh38): 3:12,557,087-12,583,713 (from NCBI)

This gene has 14 transcripts (splice variants), 210 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 30.6), thyroid (RPKM 16.5) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码可能包含多个锌指结构域的 E3 泛素连接酶，它是 makorin RING 锌指蛋白家族的成员。该基因以反义方向与 v-raf-1 小鼠白血病病毒癌基因同系物 1 (RAF1) 基因重叠，可能与 RAF1 具有共同调节功能。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2012 年 11 月]

This gene encodes a probable E3 ubiquitin Ligase containing several zinc finger domains, that is a member of the makorin RING zinc-finger protein family. This gene overlaps the v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1 (RAF1) gene in an antisense orientation and may have a co-regulatory function with RAF1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2012]

MKRN2 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001271707.2 NP_001258636.1 E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2 isoform 2
NM_014160.5 NP_054879.3 E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17500595 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

MKRN2 蛋白结构

zf-CCCH_2

zf-CCCH_2: RNA-binding, Nab2-type zinc finger (8 - 26)

zf-CCCH

zf-CCCH: Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) (36 - 55)

zf-CCCH

zf-CCCH: Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) (169 - 191)

zf-C3HC4

zf-C3HC4: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (238 - 291)

zf-CCCH_2

zf-CCCH_2: RNA-binding, Nab2-type zinc finger (333 - 348)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 416 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2

RING finger protein 62

MKRN2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
MKRN2 Q9H000 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Y2H Array
32814053
种属内
MKRN2 Q9H000 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Validated Y2H
32814053
种属内
MKRN2 Q9H000 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Y2H Pooling
32814053
种属间
MKRN2 Q9H000 P0C6X7-PRO_0000037311 Human SARS coronavirus P0C6X7-PRO_0000037311
Y2H Pooling
22046132
种属间
MKRN2 Q9H000 P0C6X7-PRO_0000037311 Human SARS coronavirus P0C6X7-PRO_0000037311
Lumier
22046132
种属内
MKRN2 Q9H000 HTT Homo sapiens P42858
Y2H
17500595
种属内
MKRN2 Q9H000 UBE2D1 Homo sapiens P51668
Y2H Array
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 UBE2D1 Homo sapiens P51668
Validated Y2H
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8
Validated Y2H
32296183
种属内
MKRN2 Q9H000 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8
Y2H Array
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 UBE2D4 Homo sapiens Q9Y2X8
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 DR1 Homo sapiens Q01658
Validated Y2H
32814053
种属内
MKRN2 Q9H000 DR1 Homo sapiens Q01658
Y2H Array
32814053
种属内
MKRN2 Q9H000 DR1 Homo sapiens Q01658
Y2H Pooling
32814053
种属内
MKRN2 Q9H000 e9kl35_human Homo sapiens E9KL35
Validated Y2H
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 AIRIM Homo sapiens Q9NX04
Y2H Array
25416956
种属内
MKRN2 Q9H000 AIRIM Homo sapiens Q9NX04
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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纯度 是否罕见病
HY-RS08480 MKRN2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
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