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SYF2 - SYF2 pre-mRNA splicing factor Gene

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中文名称：SYF2 前体 mRNA 剪接因子

种属: Homo sapiens

同用名: P29; CBPIN; NTC31; fSAP29

基因 ID: 25949 | 基因类型: protein coding

关于 SYF2

Cytogenetic location: 1p36.11 Genomic coordinates (GRCh38): 1:25,222,276-25,232,502 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants) and 210 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 39.9), ovary (RPKM 37.8) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种与细胞周期蛋白 D 型结合蛋白 1 相互作用的核蛋白，该蛋白被认为是 G1/S 转换时的细胞周期调节剂。已经表征了编码不同亚型的替代转录剪接变体。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a nuclear protein that interacts with cyclin D-type binding-protein 1, which is thought to be a cell cycle regulator at the G1/S transition. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SYF2 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_015484.5 NP_056299.1 pre-mRNA-splicing factor SYF2 isoform 1
NM_207170.4 NP_997053.1 pre-mRNA-splicing factor SYF2 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
28076346 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of U2-type catalytic step 2 spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
28076346 GOA
part of catalytic step 2 spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
11991638 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
28076346 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SYF2 蛋白结构

SYF2

SYF2: SYF2 splicing factor (90 - 238)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 243 a.a.
蛋白主名 其他名称

pre-mRNA-splicing factor SYF2

CCNDBP1 interactor

SYF2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SYF2 O95926 ARMC7 Homo sapiens Q9H6L4
Validated Y2H
32296183
Intra SYF2 O95926 MLH1 Homo sapiens P40692
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS14074 SYF2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta SYF2 VGNC VGNC:78174
Rattus norvegicus SYF2 RGD RGD:621592
Bos taurus SYF2 VGNC VGNC:35512
Mus musculus SYF2 MGD MGI:1915842
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