1. Gene
  2. APOBEC3C - apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C Gene

APOBEC3C - apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C Gene

中文名称:载脂蛋白 B mRNA 编辑酶催化亚基 3C

种属: Homo sapiens

同用名: A3C; PBI; ARP5; ARDC2; ARDC4; APOBEC1L; bK150C2.3

基因 ID: 27350 | 基因类型: protein coding

关于 APOBEC3C

Cytogenetic location: 22q13.1 Genomic coordinates (GRCh38): 22:39,014,257-39,020,352 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants), 55 orthologues and 9 paralogues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 33.1), testis (RPKM 26.8) and 24 other tissues.

功能概要

该基因是胞苷脱氨酶基因家族的成员。它是在一个簇中发现的七个相关基因或假基因之一,该簇被认为是由 22 号染色体上的基因复制引起的。该簇的成员编码的蛋白质在结构和功能上与 C 到 U RNA 编辑胞苷脱氨酶 APOBEC1 相关。人们认为这些蛋白质可能是 RNA 编辑酶,在生长或细胞周期控制中发挥作用。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene is a member of the cytidine deaminase gene family. It is one of seven related genes or pseudogenes found in a cluster thought to result from gene duplication, on chromosome 22. Members of the cluster encode proteins that are structurally and functionally related to the C to U RNA-editing cytidine deaminase APOBEC1. It is thought that the proteins may be RNA editing Enzymes and have roles in growth or cell cycle control. [provided by RefSeq, Jul 2008]

APOBEC3C 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_014508.3 NP_055323.2 DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
22915799 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in clearance of foreign intracellular DNA IDA
IDA: 通过直接分析推断
20062055 GOA
involved in cytidine deamination IDA
IDA: 通过直接分析推断
21632763 GOA
involved in negative regulation of viral genome replication IDA
IDA: 通过直接分析推断
21632763 GOA
involved in positive regulation of gene expression via chromosomal CpG island demethylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
21496894 GOA
involved in retrotransposon silencing IDA
IDA: 通过直接分析推断
16527742 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

APOBEC3C 蛋白结构

APOBEC_N

APOBEC_N: APOBEC-like N-terminal domain (19 - 185)

  • 0
  • 100
  • 190 a.a.
蛋白主名 其他名称

DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C

apolipoprotein B editing enzyme catalytic polypeptide-like 3C

APOBEC3C 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra APOBEC3C Q9NRW3 CHTOP Homo sapiens Q9Y3Y2-3
Validated Y2H
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 CHTOP Homo sapiens Q9Y3Y2-3
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 CHTOP Homo sapiens Q9Y3Y2-3
Y2H Array
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 ZNF48 Homo sapiens Q96MX3
Anti Tag CoIP
33961781
Intra APOBEC3C Q9NRW3 PRR3 Homo sapiens P79522
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 PRR3 Homo sapiens P79522
Y2H Array
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Y2H Array
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Anti Tag CoIP
33961781
Intra APOBEC3C Q9NRW3 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMX Homo sapiens P38159
Validated Y2H
25416956
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMX Homo sapiens P38159
Y2H Array
25416956
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMX Homo sapiens P38159
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMX Homo sapiens P38159
Y2H Array
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 ZNF581 Homo sapiens Q9P0T4
Validated Y2H
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1A1 Homo sapiens P0DJD3
Validated Y2H
25416956
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1A1 Homo sapiens P0DJD3
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Validated Y2H
25416956
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Y2H Array
32296183
Intra APOBEC3C Q9NRW3 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Plantar Wart

Verruca Plantaris

Verrucae On Sole Of Foot

Mosaic Plantar Warts

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus APOBEC3C MGD MGI:1933111