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SSU72 - SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase Gene

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中文名称：SSU72 同系物，RNA 聚合酶 II CTD 磷酸酶

种属: Homo sapiens

同用名: HSPC182; PNAS-120

基因 ID: 29101 | 基因类型: protein coding

关于 SSU72

Cytogenetic location: 1p36.33 Genomic coordinates (GRCh38): 1:1,541,673-1,574,863 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 157 orthologues and 6 paralogues. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 50.5), fat (RPKM 49.2) and 25 other tissues.

功能概要

启用 RNA 聚合酶 II CTD 七肽重复磷酸酶活性。参与 RNA 聚合酶 II C 末端结构域的去磷酸化和 mRNA 聚腺苷酸化。位于细胞质和核质中。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat Phosphatase activity. Involved in dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain and mRNA polyadenylation. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SSU72 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_014188.3 NP_054907.1 RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
20861839 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20818333 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in co-transcriptional mRNA 3'-end processing, cleavage and polyadenylation pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
20861839 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SSU72 蛋白结构

Ssu72

Ssu72: Ssu72-like protein (5 - 194)

  • 0
  • 100
  • 194 a.a.
蛋白主名 其他名称

RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72

CTD phosphatase SSU72

SSU72 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SSU72 Q9NP77 STAG2 Homo sapiens Q8N3U4
Anti Bait CoIP
20818333
种属内
SSU72 Q9NP77 STAG2 Homo sapiens Q8N3U4
Pull Down
20818333
种属内
SSU72 Q9NP77 RAD21 Homo sapiens O60216
Pull Down
20818333
种属内
SSU72 Q9NP77 RAD21 Homo sapiens O60216
IF
20818333
种属内
SSU72 Q9NP77 RAD21 Homo sapiens O60216
Y2H
20818333
种属内
SSU72 Q9NP77 RAD21 Homo sapiens O60216
Anti Bait CoIP
20818333
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13835 SSU72 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta SSU72 VGNC VGNC:77986
Rattus norvegicus SSU72 RGD RGD:1307854
Mus musculus SSU72 MGD MGI:1916241
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