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Sigmar1 - sigma non-opioid intracellular receptor 1 Gene

中文名称:西格玛非阿片类细胞内受体 1

种属: Rattus norvegicus

同用名: Oprs1

基因 ID: 29336 | 基因类型: protein coding

关于 Sigmar1

Primary_assembly 5: 56,904,159-56,907,017 reverse strand.mRatBN7.2:CM026978.1

This gene has 2 transcripts (splice variants), 206 orthologues and is associated with 14 phenotypes. Biased expression in Liver (RPKM 836.2), Kidney (RPKM 18.1) and 9 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动 G 蛋白偶联阿片受体活性。参与神经系统发育。预测位于膜内;核包膜;和突触后密度。预计是膜的组成部分。预计在内质网中有活性。该基因的人类直向同源基因与 16 型肌萎缩侧索硬化症和远端脊髓性肌萎缩症 2 相关。与人类 SIGMAR1(σ 非阿片类细胞内受体 1)直向同源。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables G protein-coupled Opioid Receptor activity. Involved in nervous system development. Predicted to be located in membrane; nuclear envelope; and postsynaptic density. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Human ortholog(s) of this gene implicated in amyotrophic lateral sclerosis type 16 and distal spinal muscular atrophy 2. Orthologous to human SIGMAR1 (sigma non-opioid intracellular receptor 1). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Sigmar1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_030996.2 NP_112258.2 sigma non-opioid intracellular receptor 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables G protein-coupled opioid receptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
12438547 RGD
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17981125 RGD
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in nervous system development IDA
IDA: 通过直接分析推断
12438547 RGD
involved in regulation of postsynapse assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
20018732 RGD
involved in regulation of postsynapse assembly IMP
IMP: 通过突变表型推断
20018732 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in glutamatergic synapse IDA
IDA: 通过直接分析推断
20018732 RGD
is active in glutamatergic synapse IMP
IMP: 通过突变表型推断
20018732 RGD
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

Sigmar1 蛋白结构

ERG2_Sigma1R

ERG2_Sigma1R: pfam04622 (25 - 213)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 223 a.a.
蛋白主名 其他名称

sigma non-opioid intracellular receptor 1

opioid receptor, sigma 1

sigma 1-type opioid receptor

sigma1-receptor

sigma1R

Sigmar1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
Sigmar1 Q9R0C9 Kcna2 Mus musculus P63141
Anti Bait CoIP
23332758
种属内
Sigmar1 Q9R0C9 Hspa5 Rattus norvegicus P06761
Pull Down
17981125
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Sigmar1 NCBI NCBI:10280