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HOXC10 - homeobox C10 Gene

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中文名称：同源盒 C10

种属: Homo sapiens

同用名: HOX3I

基因 ID: 3226 | 基因类型: protein coding

关于 HOXC10

Cytogenetic location: 12q13.13 Genomic coordinates (GRCh38): 12:53,985,146-53,990,279 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 197 orthologues and 42 paralogues. Biased expression in kidney (RPKM 15.8), skin (RPKM 3.7) and 5 other tissues.

功能概要

该基因属于同源盒基因家族。同源框基因编码一个高度保守的转录因子家族，在所有多细胞生物的形态发生中起着重要作用。哺乳动物拥有 4 个相似的同源盒基因簇 HOXA、HOXB、HOXC 和 HOXD，它们分别位于不同的染色体上，由 9～11 个串联排列的基因组成。该基因是位于 12 号染色体簇中的几个同源盒 HOXC 基因之一。蛋白质水平在细胞分化和增殖过程中受到控制，这可能表明该蛋白质在起源激活中起作用。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene belongs to the homeobox family of genes. The homeobox genes encode a highly conserved family of transcription factors that play an important role in morphogenesis in all multicellular organisms. Mammals possess four similar homeobox gene clusters, HOXA, HOXB, HOXC and HOXD, which are located on different chromosomes and consist of 9 to 11 genes arranged in tandem. This gene is one of several homeobox HOXC genes located in a cluster on chromosome 12. The protein level is controlled during cell differentiation and proliferation, which may indicate this protein has a role in origin activation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

HOXC10 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017409.4 NP_059105.2 homeobox protein Hox-C10
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific IDA
IDA: 通过直接分析推断
10835276 GOA
enables RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10835276 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables sequence-specific double-stranded DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
28473536 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of cold-induced thermogenesis IMP
IMP: 通过突变表型推断
28186086 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
10835276 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

HOXC10 蛋白结构

Homeobox

Homeobox: Homeobox domain (269 - 325)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 342 a.a.
蛋白主名 其他名称

homeobox protein Hox-C10

homeo box C10

HOXC10 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra HOXC10 Q9NYD6 USP21 Homo sapiens Q9UK80
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS06314 HOXC10 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus HOXC10 MGD MGI:96192
Canis familiaris HOXC10 VGNC VGNC:41756
Felis catus HOXC10 VGNC VGNC:67625
Macaca mulatta HOXC10 VGNC VGNC:73506
Bos taurus HOXC10 VGNC VGNC:56206
Rattus norvegicus HOXC10 RGD RGD:1307250
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