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  3. SS18L2 - SS18 like 2 Gene

SS18L2 - SS18 like 2 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：SS18 样 2

种属: Homo sapiens

同用名: KIAA-iso

基因 ID: 51188 | 基因类型: protein coding

关于 SS18L2

Cytogenetic location: 3p22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 3:42,581,840-42,596,934 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 202 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 8.2), prostate (RPKM 6.4) and 25 other tissues.

功能概要

滑膜肉瘤最常发生在大关节周围的四肢。超过 90% 的病例有反复发生的特异性染色体易位，t (X;18) (p11.2;q11.2) ，其中 SS18 基因 (MIM 600192) 的 5-prime 末端在读框内融合到 SSX1 (MIM 312820) 、SSX2 (MIM 300192) 或 SSX4 (MIM 300326) 基因的 3-素数末端。 SS18L2 基因与 SS18 同源。[OMIM 提供，2002 年 7 月]

Synovial sarcomas occur most frequently in the extremities around large joints. More than 90% of cases have a recurrent and specific chromosomal translocation, t(X;18)(p11.2;q11.2), in which the 5-prime end of the SS18 gene (MIM 600192) is fused in-frame to the 3-prime end of the SSX1 (MIM 312820), SSX2 (MIM 300192), or SSX4 (MIM 300326) gene. The SS18L2 gene is homologous to SS18.[supplied by OMIM, Jul 2002]

SS18L2 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001370300.1 NP_001357229.1 SS18-like protein 2
NM_016305.4 NP_057389.1 SS18-like protein 2
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
28514442 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SS18L2 蛋白结构

SSXT

SSXT: SSXT protein (N-terminal region) (11 - 75)

  • 0
  • 77 a.a.
蛋白主名 其他名称

SS18-like protein 2

SYT homolog 2

SS18L2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SS18L2 Q9UHA2 GNG3 Homo sapiens P63215
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 GNG3 Homo sapiens P63215
Y2H Array
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 TMEM17 Homo sapiens Q86X19
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 TMEM17 Homo sapiens Q86X19
Y2H Array
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 LYPD6 Homo sapiens Q86Y78
Y2H Array
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 LYPD6 Homo sapiens Q86Y78
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 MBD5 Homo sapiens Q9P267-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 MBD5 Homo sapiens Q9P267-2
Y2H Array
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 EMC2 Homo sapiens Q15006
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SS18L2 Q9UHA2 EMC2 Homo sapiens Q15006
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13803 SS18L2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris SS18L2 VGNC VGNC:46825
Rattus norvegicus SS18L2 RGD RGD:1590139
Felis catus SS18L2 VGNC VGNC:102850
Mus musculus SS18L2 MGD MGI:1349474
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