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PRPF39 - pre-mRNA processing factor 39 Gene

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中文名称：pre-mRNA 加工因子 39

种属: Homo sapiens

基因 ID: 55015 | 基因类型: protein coding

关于 PRPF39

Cytogenetic location: 14q21.2 Genomic coordinates (GRCh38): 14:45,084,116-45,116,282 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants) and 210 orthologues. Ubiquitous expression in skin (RPKM 15.3), prostate (RPKM 14.2) and 25 other tissues.

功能概要

预计参与 mRNA 5'-剪接位点识别。预计是 U1 snRNP 的一部分； U2 型预剪接体；和承诺复杂。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to be involved in mRNA 5'-splice site recognition. Predicted to be part of U1 snRNP; U2-type prespliceosome; and commitment complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

PRPF39 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017922.4 NP_060392.3 pre-mRNA-processing factor 39
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

pre-mRNA-processing factor 39

PRP39 homolog

PRPF39 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PRPF39 Q86UA1 ATN1 Homo sapiens Q86V38
Y2H Pooling
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 ATN1 Homo sapiens Q86V38
Validated Y2H
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 ATN1 Homo sapiens Q86V38
Y2H Array
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 FGFR3 Homo sapiens P22607
Validated Y2H
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 FGFR3 Homo sapiens P22607
Y2H Array
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 FGFR3 Homo sapiens P22607
Y2H Pooling
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 SMN1 Homo sapiens Q16637
Y2H Pooling
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 SMN1 Homo sapiens Q16637
Validated Y2H
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 SMN1 Homo sapiens Q16637
Y2H Array
32814053
种属内
PRPF39 Q86UA1 TOLLIP Homo sapiens Q9H0E2
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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HY-RS11210 PRPF39 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus PRPF39 VGNC VGNC:33377
Mus musculus PRPF39 MGD MGI:104602
Felis catus PRPF39 VGNC VGNC:64373
Rattus norvegicus PRPF39 RGD RGD:1308702
Macaca mulatta PRPF39 VGNC VGNC:76292
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