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RAB5B - RAB5B, member RAS oncogene family Gene

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中文名称：RAB5B，RAS 致癌基因家族成员

种属: Homo sapiens

基因 ID: 5869 | 基因类型: protein coding

关于 RAB5B

Cytogenetic location: 12q13.2 Genomic coordinates (GRCh38): 12:55,973,949-55,996,683 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 135 orthologues and 68 paralogues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 35.5), esophagus (RPKM 35.2) and 25 other tissues.

功能概要

启用 GDP 绑定活动； GTP 依赖性蛋白结合活性；和 GTPase 活性。参与抗原加工和呈递以及质膜到核内体的转运。位于核内体和细胞外外体。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables GDP binding activity; GTP-dependent protein binding activity; and GTPase activity. Involved in antigen processing and presentation and plasma membrane to endosome transport. Located in endosome and extracellular exosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RAB5B 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001252036.2 NP_001238965.1 ras-related protein Rab-5B isoform 1
NM_001252037.2 NP_001238966.1 ras-related protein Rab-5B isoform 2
NM_001414457.1 NP_001401386.1 ras-related protein Rab-5B isoform 1
NM_001414458.1 NP_001401387.1 ras-related protein Rab-5B isoform 3
NM_002868.4 NP_002859.1 ras-related protein Rab-5B isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables GDP binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20937701 GOA
enables GTP-dependent protein binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10491193 GOA
enables GTPase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
17562788 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10491193 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in antigen processing and presentation IMP
IMP: 通过突变表型推断
19717423 GOA
involved in plasma membrane to endosome transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
17562788 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in endosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
10491193 GOA
located in extracellular exosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
15326289 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RAB5B 蛋白结构

Ras

Ras: Ras family (22 - 181)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 215 a.a.
蛋白主名 其他名称

ras-related protein Rab-5B

RAB5B 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RAB5B P61020 EEA1 Homo sapiens Q15075
Y2H
10491193
种属内
RAB5B P61020 EEA1 Homo sapiens Q15075
IF
10491193
种属内
RAB5B P61020 LRRK2 Homo sapiens Q5S007
GTPase Assay
25605758
种属内
RAB5B P61020 LRRK2 Homo sapiens Q5S007
Y2H
18445495
种属内
RAB5B P61020 LRRK2 Homo sapiens Q5S007
Protein Kinase Assay
25605758
种属内
RAB5B P61020 LRRK2 Homo sapiens Q5S007
Anti Bait CoIP
18445495
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11572 RAB5B Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus RAB5B MGD MGI:105938
Bos taurus RAB5B VGNC VGNC:33659
Macaca mulatta RAB5B VGNC VGNC:81546
Rattus norvegicus RAB5B RGD RGD:1306489
Canis familiaris RAB5B VGNC VGNC:45292
Felis catus RAB5B VGNC VGNC:97593
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