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RABGGTA - Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha Gene

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中文名称：Rab 香叶基香叶基转移酶亚基α

种属: Homo sapiens

同用名: PTAR3

基因 ID: 5875 | 基因类型: protein coding

关于 RABGGTA

Cytogenetic location: 14q12 Genomic coordinates (GRCh38): 14:24,265,538-24,271,627 (from NCBI)

This gene has 21 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 181 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in esophagus (RPKM 19.5), lung (RPKM 8.4) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用小 GTPase 绑定活动。预测有助于 Rab 香叶基香叶基转移酶活性。预计参与蛋白质香叶基香叶基化。位于核质中。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable small GTPase binding activity. Predicted to contribute to Rab geranylgeranyltransferase activity. Predicted to be involved in protein geranylgeranylation. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RABGGTA 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_004581.5 NP_004572.3 geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha
NM_182836.3 NP_878256.1 geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21905166 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RABGGTA 蛋白结构

PPTA

PPTA: Protein prenyltransferase alpha subunit repeat (49 - 77)

PPTA

PPTA: Protein prenyltransferase alpha subunit repeat (92 - 121)

PPTA

PPTA: Protein prenyltransferase alpha subunit repeat (127 - 154)

PPTA

PPTA: Protein prenyltransferase alpha subunit repeat (162 - 192)

PPTA

PPTA: Protein prenyltransferase alpha subunit repeat (210 - 238)

RabGGT_insert

RabGGT_insert: Rab geranylgeranyl transferase alpha-subunit, insert domain (243 - 345)

LRR_1

LRR_1: Leucine Rich Repeat (466 - 484)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 567 a.a.
蛋白主名 其他名称

geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha

Rab GG transferase alpha

RABGGTA 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RABGGTA Q92696 CHM Homo sapiens P24386
Anti Tag CoIP
21905166
Intra RABGGTA Q92696 CHM Homo sapiens P24386
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RABGGTA Q92696 CHM Homo sapiens P24386
Anti Tag CoIP
28514442
Intra RABGGTA Q92696 CHM Homo sapiens P24386
Anti Tag CoIP
35271311
Intra RABGGTA Q92696 RABGGTB Homo sapiens P53611
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RABGGTA Q92696 RABGGTB Homo sapiens P53611
Anti Tag CoIP
35271311
Intra RABGGTA Q92696 RABGGTB Homo sapiens P53611
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RABGGTA Q92696 RABGGTB Homo sapiens P53611
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Choroideremia

CHM

Tcd

Progressive Tapetochoroidal Dystrophy

Choroidal Sclerosis

Tapetochoroidal Dystrophy, Progressive

Progressive Choroidal Atrophy

Tapetochoroidal Dystrophy
Hermansky-Pudlak Syndrome

Hps

Albinism With Hemorrhagic Diathesis And Pigmented Reticuloendothelial Cells

Hermanski-Pudlak Syndrome

Hermansky Pudlak Syndrome

Platelet Storage Pool Deficiency
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11587 RABGGTA Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus RABGGTA MGD MGI:1860443
Rattus norvegicus RABGGTA RGD RGD:621697
Macaca mulatta RABGGTA VGNC VGNC:76640
Canis familiaris RABGGTA VGNC VGNC:45303
Felis catus RABGGTA VGNC VGNC:69207
Bos taurus RABGGTA VGNC VGNC:33670
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