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RAB5C - RAB5C, member RAS oncogene family Gene

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中文名称：RAB5C，RAS 致癌基因家族成员

种属: Homo sapiens

同用名: RABL; L1880; RAB5L; RAB5CL

基因 ID: 5878 | 基因类型: protein coding

关于 RAB5C

Cytogenetic location: 17q21.2 Genomic coordinates (GRCh38): 17:42,124,979-42,154,989 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 274 orthologues and 68 paralogues. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 55.2), bone marrow (RPKM 47.2) and 25 other tissues.

功能概要

Rab 蛋白家族的成员是 Ras 超家族的小 GTP 酶，被认为可确保囊泡与其正确的受体室对接和/或融合过程中的保真度 (Han 等人，1996 [PubMed 8646882]) 。[已提供 OMIM，2010 年 11 月]

Members of the Rab protein family are small GTPases of the Ras superfamily that are thought to ensure fidelity in the process of docking and/or fusion of vesicles with their correct acceptor compartment (Han et al., 1996 [PubMed 8646882]).[supplied by OMIM, Nov 2010]

RAB5C 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001252039.2 NP_001238968.1 ras-related protein Rab-5C isoform b
NM_004583.4 NP_004574.2 ras-related protein Rab-5C isoform a
NM_201434.3 NP_958842.1 ras-related protein Rab-5C isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables GDP binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20937701 GOA
enables GTPase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
17562788 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17562788 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in plasma membrane to endosome transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
17562788 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in lipid droplet IDA
IDA: 通过直接分析推断
14741744 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RAB5C 蛋白结构

Ras

Ras: Ras family (23 - 182)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 216 a.a.
蛋白主名 其他名称

ras-related protein Rab-5C

RAB5C, member of RAS oncogene family

RAB5C 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RAB5C P51148 ALS2CL Homo sapiens Q60I27
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
RAB5C P51148 ALS2CL Homo sapiens Q60I27
Y2H Array
32296183
种属内
RAB5C P51148 ALS2CL Homo sapiens Q60I27
Validated Y2H
32296183
种属内
RAB5C P51148 EEA1 Homo sapiens Q15075
Pull Down
25266290
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Validated Y2H
32296183
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Validated Y2H
25416956
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Y2H Array
32296183
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Y2H Array
25416956
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Y2H Array
31515488
种属内
RAB5C P51148 APPL2 Homo sapiens Q8NEU8
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11573 RAB5C Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus RAB5C VGNC VGNC:99428
Rattus norvegicus RAB5C RGD RGD:1307095
Canis familiaris RAB5C VGNC VGNC:55798
Bos taurus RAB5C VGNC VGNC:50253
Mus musculus RAB5C MGD MGI:105306
Others RAB5C NCBI
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