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NTN4 - netrin 4 Gene

中文名称:netrin 4

种属: Homo sapiens

同用名: PRO3091

基因 ID: 59277 | 基因类型: protein coding

关于 NTN4

Cytogenetic location: 12q22 Genomic coordinates (GRCh38): 12:95,657,807-95,791,155 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 248 orthologues and 27 paralogues. Broad expression in spleen (RPKM 88.7), kidney (RPKM 62.7) and 20 other tissues.

功能概要

该基因编码 netrin 蛋白家族的一个成员,该蛋白在各种生物过程中发挥作用,包括轴突导向、肿瘤发生和血管生成。 Netrins 是层粘连蛋白相关蛋白,具有 N 端层粘连蛋白型结构域、表皮生长因子样重复结构域和 C 端带正电荷的肝素结合结构域。由该基因编码的蛋白质参与包括神经突生长和迁移、血管生成和壁细胞与内皮细胞的粘附在内的过程。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2016 年 7 月]

This gene encodes a member of the netrin family of proteins, which function in various biological processes including axon guidance, tumorogenesis, and angiogenesis. Netrins are laminin-related proteins that have an N-terminal laminin-type domain, epidermal growth factor-like repeat domain, and a positively charged heparin-binding domain at the C-terminus. The protein encoded by this gene is involved in processes including neurite growth and migration, angiogenesis and mural cell adhesion to endothelial cells. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2016]

NTN4 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001329700.2 NP_001316629.1 netrin-4 isoform 2 precursor
NM_001329701.2 NP_001316630.1 netrin-4 isoform 3
NM_001329702.2 NP_001316631.1 netrin-4 isoform 3
NM_021229.4 NP_067052.2 netrin-4 isoform 1 precursor
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21516116 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

NTN4 蛋白结构

Laminin_N

Laminin_N: Laminin N-terminal (Domain VI) (34 - 260)

Laminin_EGF

Laminin_EGF: Laminin EGF domain (262 - 318)

Laminin_EGF

Laminin_EGF: Laminin EGF domain (332 - 383)

Laminin_EGF

Laminin_EGF: Laminin EGF domain (395 - 443)

NTR

NTR: UNC-6/NTR/C345C module (518 - 621)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 628 a.a.
蛋白主名 其他名称

netrin-4

beta-netrin

NTN4 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP10-8 Homo sapiens P60410
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP10-8 Homo sapiens P60410
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KPRP Homo sapiens Q5T749
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KPRP Homo sapiens Q5T749
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 CASK Homo sapiens O14936-4
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 CASK Homo sapiens O14936-4
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 LCE1C Homo sapiens Q5T751
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 LCE1C Homo sapiens Q5T751
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 MEOX2 Homo sapiens Q6FHY5
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 MEOX2 Homo sapiens Q6FHY5
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP21-2 Homo sapiens Q3LI59
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP21-2 Homo sapiens Q3LI59
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 NOTCH2NLC Homo sapiens P0DPK4
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 NOTCH2NLC Homo sapiens P0DPK4
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP5-9 Homo sapiens P26371
Y2H Array
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 KRTAP5-9 Homo sapiens P26371
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 PECAM1 Homo sapiens P16284
Validated Y2H
32814053
种属内
NTN4 Q9HB63 PECAM1 Homo sapiens P16284
Y2H Array
32814053
种属内
NTN4 Q9HB63 PECAM1 Homo sapiens P16284
Y2H Pooling
32814053
种属内
NTN4 Q9HB63 HOXA1 Homo sapiens P49639
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
NTN4 Q9HB63 HOXA1 Homo sapiens P49639
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus NTN4 VGNC VGNC:63904
Rattus norvegicus NTN4 RGD RGD:1565947
Canis familiaris NTN4 VGNC VGNC:44009
Bos taurus NTN4 VGNC VGNC:32306
Macaca mulatta NTN4 VGNC VGNC:75399
Mus musculus NTN4 MGD MGI:1888978
Others NTN4 NCBI