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TRIM26 - tripartite motif containing 26 Gene

中文名称:含三方基序 26

种属: Homo sapiens

同用名: AFP; RNF95; ZNF173

基因 ID: 7726 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM26

Cytogenetic location: 6p22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 6:30,184,455-30,213,406 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 157 orthologues and 80 paralogues. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 14.9), spleen (RPKM 12.6) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是三联基序 (TRIM) 家族的成员。 TRIM 基序包括三个锌结合域、一个 RING、一个 B-box 类型 1 和一个 B-box 类型 2,以及一个卷曲螺旋区域。该蛋白质定位于细胞质体。尽管蛋白质的功能未知,但 RING 结构域表明该蛋白质可能具有 DNA 结合活性。该基因定位于 6 号染色体上的主要组织相容性复合体 (MHC) I 类区域。已发现该基因编码相同蛋白质的可变剪接转录变体。[RefSeq 提供,2011 年 6 月]

The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. Although the function of the protein is unknown, the RING domain suggests that the protein may have DNA-binding activity. The gene localizes to the major histocompatibility complex (MHC) class I region on chromosome 6. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011]

TRIM26 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001242783.2 NP_001229712.1 tripartite motif-containing protein 26
NM_003449.5 NP_003440.1 tripartite motif-containing protein 26
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21516116 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
29203640 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
34017102 GOA
is active in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
25763818 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TRIM26 蛋白结构

zf-C3HC4_4

zf-C3HC4_4: zinc finger of C3HC4-type, RING (16 - 56)

zf-B_box

zf-B_box: B-box zinc finger (99 - 136)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 248 a.a.
蛋白主名 其他名称

tripartite motif-containing protein 26

RING finger protein 95

TRIM26 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TRIM26 Q12899 BEND7 Homo sapiens Q8N7W2-2
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 BEND7 Homo sapiens Q8N7W2-2
Validated Y2H
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 BEND7 Homo sapiens Q8N7W2-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 MAGEA6 Homo sapiens P43360
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 MAGEA6 Homo sapiens P43360
Y2H
21516116
种属内
TRIM26 Q12899 MAGEA6 Homo sapiens P43360
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 TLE5 Homo sapiens Q08117-2
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 TLE5 Homo sapiens Q08117-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 EPN2 Homo sapiens O95208-2
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 EPN2 Homo sapiens O95208-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 BIVM Homo sapiens Q86UB2
Validated Y2H
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 BIVM Homo sapiens Q86UB2
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 BIVM Homo sapiens Q86UB2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 EPN3 Homo sapiens I6L9I8
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 EPN3 Homo sapiens I6L9I8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 MACROH2A1 Homo sapiens O75367
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 MACROH2A1 Homo sapiens O75367
Y2H Array
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 TLE5 Homo sapiens Q08117
Validated Y2H
25416956
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Validated Y2H
25416956
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Validated Y2H
32296183
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Y2H Array
25416956
种属内
TRIM26 Q12899 THAP1 Homo sapiens Q9NVV9
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Neural Tube Defects

Spina Bifida

Neural Tube Defect

NTD

Neural Tube Defects, Susceptibility To

Spinal Dysraphism

Spina Bifida, Susceptibility To

Rachischisis

Cleft Spine

Open Spine

Hydrocele Spinalis

Neural Tube Defect Nos

Sb - [Spina Bifida]

Spinal Hernia Nos

Spinal Fissure Nos

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta TRIM26 VGNC VGNC:78854
Rattus norvegicus TRIM26 RGD RGD:1359126
Mus musculus TRIM26 MGD MGI:1337056