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CORO7 - coronin 7 Gene

中文名称:冠宁 7

种属: Homo sapiens

同用名: CRN7; POD1; 0610011B16Rik

基因 ID: 79585 | 基因类型: protein coding

关于 CORO7

Cytogenetic location: 16p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 16:4,354,542-4,416,596 (from NCBI)

This gene has 33 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 200 orthologues and 6 paralogues. Broad expression in bone marrow (RPKM 25.2), spleen (RPKM 18.8) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码 coronin 蛋白家族的一个成员。然而,与其他冠状蛋白不同,它不是肌动蛋白结合蛋白,而是作为 F-肌动蛋白调节剂发挥作用,指导顺行高尔基体进行核内体运输。编码的蛋白质有两个串联的 WD-40 结构域重复序列并定位于跨高尔基体网络。该蛋白质通过 E3 连接酶复合物进行 K33 连接的多泛素化。它被认为在维持高尔基体形态方面发挥重要作用。可变剪接导致多个转录本变体;其中一些与邻近基因形成通读转录本。[RefSeq 提供,2016 年 12 月]

This gene encodes a member of the coronin protein family. However, unlike Other coronin proteins, it is not an actin-binding protein but rather functions as an F-actin regulator directing anterograde Golgi to endosome transport. The encoded protein has two tandem WD-40 domain repeats and localizes to the trans-Golgi network. The protein undergoes K33-linked polyubiquitination via an E3 Ligase complex. It is thought to play an essential role in maintenance of Golgi apparatus morphology. Alternative splicing results in multiple transcripts variants; some of which form read-through transcripts with a neighboring gene. [provided by RefSeq, Dec 2016]

CORO7 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001201472.2 NP_001188401.1 coronin-7 isoform 2
NM_001201473.2 NP_001188402.1 coronin-7 isoform 3
NM_001351729.2 NP_001338658.1 coronin-7 isoform 4
NM_024535.5 NP_078811.3 coronin-7 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables actin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
24768539 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21130766 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in Golgi to endosome transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
24768539 GOA
involved in actin filament polymerization IMP
IMP: 通过突变表型推断
24768539 GOA
involved in positive regulation of hippo signaling IMP
IMP: 通过突变表型推断
33162394 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in trans-Golgi network IDA
IDA: 通过直接分析推断
24768539 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CORO7 蛋白结构

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (70 - 105)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (159 - 196)

Trimer_CC

Trimer_CC: Trimerisation motif (252 - 385)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (543 - 572)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (586 - 623)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (632 - 664)

Trimer_CC

Trimer_CC: Trimerisation motif (721 - 857)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 925 a.a.
蛋白主名 其他名称

coronin-7

70 kDa WD repeat tumor rejection antigen homolog

CORO7 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
CORO7 P57737 Tob1 Mus musculus Q61471 21130766
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus CORO7 RGD RGD:621591
Mus musculus CORO7 MGD MGI:1926135