RNF39 - ring finger protein 39 Gene

中文名称：无名指蛋白 39

种属: Homo sapiens

同用名: HZF; HZFW; LIRF; FAP216

基因 ID: 80352 | 基因类型: protein coding

关于 RNF39

Cytogenetic location: 6p22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 6:30,070,270-30,075,769 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 83 orthologues and 80 paralogues. Ubiquitous expression in small intestine (RPKM 5.5), duodenum (RPKM 5.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因位于 6 号染色体上的主要组织相容性复合体 I 类区域。对类似大鼠蛋白质的研究表明，该基因编码的蛋白质在突触可塑性的早期阶段发挥作用。已发现该基因编码不同异构体的多个转录变体。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene lies within the major histocompatibility complex class I region on chromosome 6. Studies of a similar rat protein suggest that this gene encodes a protein that plays a role in an early phase of synaptic plasticity. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

RNF39 基因产物(2)

mRNA	Protein	Name
NM_025236.4	NP_079512.3	RING finger protein 39 isoform 1
NM_170769.3	NP_739575.3	RING finger protein 39 isoform 2

基因本体论

分子功能

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	32296183	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RNF39 蛋白结构

zf-C3HC4_4

PRY

SPRY

0
100
200
300
420 a.a.

蛋白主名

其他名称

RING finger protein 39

LTP (long-term potentiation) induced RING finger protein

RNF39 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	RNF39	Q9H2S5	DNAAF6	Homo sapiens	Q9NQM4	Validated Y2H	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	DNAAF6	Homo sapiens	Q9NQM4	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	DNAAF6	Homo sapiens	Q9NQM4	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	AP1B1	Homo sapiens	Q10567-3	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	AP1B1	Homo sapiens	Q10567-3	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	KRT27	Homo sapiens	Q7Z3Y8	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	KRT27	Homo sapiens	Q7Z3Y8	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	RABEP1	Homo sapiens	Q15276	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	RABEP1	Homo sapiens	Q15276	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	GOLGA6L9	Homo sapiens	A6NEM1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	GOLGA6L9	Homo sapiens	A6NEM1	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	RINT1	Homo sapiens	Q6NUQ1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	RINT1	Homo sapiens	Q6NUQ1	Y2H Array	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	MORN3	Homo sapiens	Q6PF18	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	RNF39	Q9H2S5	MORN3	Homo sapiens	Q6PF18	Y2H Array	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Psoriasis 10

PSORS10	Psoriasis Susceptibility 10
Psoriasis 10, Susceptibility To

Behcet Syndrome

Behcet Disease	Behcet'S Syndrome
Behcet'S Disease	Behçet Disease
Bd	Adamantiades-Behcet Disease
Triple Symptom Complex	Behçet'S Disease
Behet'S Syndrome	Bd Syndrome
Behçet Syndrome	Behçet'S Syndrome
Behcet Triple Symptom Complex	Malignant Aphthosis
Old Silk Route Disease	Adamantiades-Behçet Disease

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12089	RNF39 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Bos taurus	RNF39	VGNC	VGNC:106899
Macaca mulatta	RNF39	VGNC	VGNC:83458
Rattus norvegicus	RNF39	RGD	RGD:628854
Canis familiaris	RNF39	VGNC	VGNC:54988
Mus musculus	RNF39	MGD	MGI:2156378

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