SEC16B - SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor Gene

中文名称：SEC16 同系物 B，内质网输出因子

种属: Homo sapiens

同用名: RGPR; LZTR2; SEC16S; PGPR-p117; RGPR-p117

基因 ID: 89866 | 基因类型: protein coding

关于 SEC16B

Cytogenetic location: 1q25.2 Genomic coordinates (GRCh38): 1:177,928,788-177,984,284 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 170 orthologues and 1 paralogue. Broad expression in small intestine (RPKM 16.8), duodenum (RPKM 16.0) and 22 other tissues.

功能概要

SEC16B 是酿酒酵母 Sec16 的哺乳动物同系物，是组织过渡内质网 (ER) 位点和蛋白质输出所必需的 (Bhattacharyya 和 Glick，2007 [PubMed 17192411]) 。[OMIM 提供，2009 年 6 月]

SEC16B is a mammalian homolog of S. cerevisiae Sec16 that is required for organization of transitional endoplasmic reticulum (ER) sites and protein export (Bhattacharyya and Glick, 2007 [PubMed 17192411]).[supplied by OMIM, Jun 2009]

SEC16B 基因产物(5)

mRNA	Protein	Name
NM_001356499.2	NP_001343428.1	protein transport protein Sec16B isoform 2
NM_001390833.1	NP_001377762.1	protein transport protein Sec16B isoform 1
NM_001390834.1	NP_001377763.1	protein transport protein Sec16B isoform 4
NM_001390835.1	NP_001377764.1	protein transport protein Sec16B isoform 4
NM_033127.4	NP_149118.2	protein transport protein Sec16B isoform 1

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	16189514	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in endoplasmic reticulum organization	IDA IDA: 通过直接分析推断	21768384	GOA
involved in endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport	IMP IMP: 通过突变表型推断	21478858	GOA
involved in peroxisome fission	IMP IMP: 通过突变表型推断	21768384	GOA
involved in peroxisome organization	IDA IDA: 通过直接分析推断	21768384	GOA
involved in positive regulation of gene expression	IMP IMP: 通过突变表型推断	21768384	GOA
involved in positive regulation of protein exit from endoplasmic reticulum	IMP IMP: 通过突变表型推断	21768384	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in endoplasmic reticulum exit site	IDA IDA: 通过直接分析推断	21478858	GOA
located in intracellular membrane-bounded organelle	IDA IDA: 通过直接分析推断	21768384	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SEC16B 蛋白结构

Sec16

Sec16_C

0
200
400
600
800
1000
1060 a.a.

蛋白主名

其他名称

protein transport protein Sec16B

leucine zipper transcription regulator 2

SEC16B 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
Intra	SEC16B	Q96JE7	SEC13	Homo sapiens	P55735	Anti Tag CoIP	33961781

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12610	SEC16B Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Felis catus	SEC16B	VGNC	VGNC:82505
Bos taurus	SEC16B	VGNC	VGNC:34407
Rattus norvegicus	SEC16B	RGD	RGD:621658
Canis familiaris	SEC16B	VGNC	VGNC:45966
Macaca mulatta	SEC16B	VGNC	VGNC:100136
Mus musculus	SEC16B	MGD	MGI:2148802

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