SNRNP40 - small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40 Gene

中文名称：小核核糖核蛋白 U5 亚基 40

种属: Homo sapiens

同用名: 40K; SPF38; WDR57; PRP8BP; HPRP8BP; PRPF8BP

基因 ID: 9410 | 基因类型: protein coding

关于 SNRNP40

Cytogenetic location: 1p35.2 Genomic coordinates (GRCh38): 1:31,259,568-31,296,788 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 211 orthologues and 26 paralogues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 17.2), testis (RPKM 14.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 U5 小核糖核蛋白 (snRNP) 颗粒的一个组成部分。 U5 snRNP 是剪接体的一部分，剪接体是一种多蛋白复合物，可催化从前信使 RNA 中去除内含子。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a component of the U5 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) particle. The U5 snRNP is part of the spliceosome, a multiprotein complex that catalyzes the removal of introns from pre-messenger RNAs. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SNRNP40 基因产物(1)

mRNA	Protein	Name
NM_004814.3	NP_004805.2	U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein

基因本体论

分子功能
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	9774689	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of U2-type catalytic step 2 spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	28076346	GOA
part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	30975767	GOA
part of catalytic step 2 spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	11991638	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNRNP40 蛋白结构

WD40

0
100
200
300
357 a.a.

蛋白主名

其他名称

U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein

38 kDa-splicing factor

SNRNP40 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SNRNP40	Q96DI7	SNRNP200	Homo sapiens	O75643	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SNRNP40	Q96DI7	SNRNP200	Homo sapiens	O75643	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	SNRNP40	Q96DI7	SNRNP200	Homo sapiens	O75643	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNRNP40	Q96DI7	SNRNP200	Homo sapiens	O75643	Anti Bait CoIP	17353931
种属内	SNRNP40	Q96DI7	EFTUD2	Homo sapiens	Q15029	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	SNRNP40	Q96DI7	EFTUD2	Homo sapiens	Q15029	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNRNP40	Q96DI7	EFTUD2	Homo sapiens	Q15029	Anti Bait CoIP	17353931
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Validated Y2H	32814053
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Pooling	32814053
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PMP22	Homo sapiens	A0A6Q8PF08	Y2H Array	32814053
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Anti Bait CoIP	9774689
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Far-WB	9774689
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Anti Tag CoIP	28514442
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNRNP40	Q96DI7	PRPF8	Homo sapiens	Q6P2Q9	Anti Bait CoIP	17353931
种属内	SNRNP40	Q96DI7	DDX23	Homo sapiens	Q9BUQ8	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNRNP40	Q96DI7	GFAP	Homo sapiens	P14136	Validated Y2H	32814053
种属内	SNRNP40	Q96DI7	GFAP	Homo sapiens	P14136	Y2H Pooling	32814053
种属内	SNRNP40	Q96DI7	GFAP	Homo sapiens	P14136	Y2H Array	32814053

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Burn-Mckeown Syndrome

Choanal Atresia-Hearing Loss-Cardiac Defects-Craniofacial Dysmorphism Syndrome	Oculootofacial Dysplasia
BMKS	Oofd
Bilateral Choanal Atresia, Cardiac Defects, Deafness, And Dysmorphic Appearance	Choanal Atresia - Deafness - Cardiac Defects - Dysmorphism Syndrome
Choanal Atresia Deafness Cardiac Defects Dysmorphism	Oculo-Oto-Facial Dysplasia

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS13498	SNRNP40 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Mus musculus	SNRNP40	MGD	MGI:1913835
Felis catus	SNRNP40	VGNC	VGNC:65534
Bos taurus	SNRNP40	VGNC	VGNC:35071
Rattus norvegicus	SNRNP40	RGD	RGD:1309198
Macaca mulatta	SNRNP40	VGNC	VGNC:100144
Canis familiaris	SNRNP40	VGNC	VGNC:46607

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