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RCL1 - RNA terminal phosphate cyclase like 1 Gene

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中文名称：RNA 末端磷酸环化酶 1

种属: Homo sapiens

同用名: RNAC; RPCL1

基因 ID: 10171 | 基因类型: protein coding

关于 RCL1

Cytogenetic location: 9p24.1 Genomic coordinates (GRCh38): 9:4,792,944-4,861,066 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 205 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in liver (RPKM 21.6), fat (RPKM 15.5) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用核糖核酸内切酶活性。预计参与三顺反子 rRNA 转录本 (SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA) 的核酸内切裂解。预测作用于三顺反子 rRNA 转录物 (SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA) 的 5'-ETS 的上游或内部，以及 ITS1 的内切核酸切割，以将 SSU-rRNA 与 5.8S rRNA 和 LSU-rRNA 从三顺反子 rRNA 转录本 (SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA) 。预测位于核质中。预计在核仁中有活性。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable endoribonuclease activity. Predicted to be involved in endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA). Predicted to act upstream of or within endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) and endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA). Predicted to be located in nucleoplasm. Predicted to be active in nucleolus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RCL1 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001286699.2 NP_001273628.1 RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein isoform b
NM_001286700.2 NP_001273629.1 RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein isoform b
NM_001286701.2 NP_001273630.1 RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein isoform c
NM_005772.5 NP_005763.3 RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in ribosomal small subunit biogenesis IDA
IDA: 通过直接分析推断
34516797 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of small-subunit processome IDA
IDA: 通过直接分析推断
34516797 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RCL1 蛋白结构

RTC

RTC: RNA 3'-terminal phosphate cyclase (7 - 342)

RTC_insert

RTC_insert: RNA 3'-terminal phosphate cyclase (RTC), insert domain (183 - 290)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 373 a.a.
蛋白主名 其他名称

RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein

RNA cyclase homolog

RCL1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RCL1 Q9Y2P8 BMS1 Homo sapiens Q14692
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RCL1 Q9Y2P8 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RCL1 Q9Y2P8 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Psychotic Disorder

Psychotic Disorders

Mental Or Behavioural Disorder

Psychotic

Mental Disorders
Breast Lipoma

Lipoma Of Breast
Intracranial Arteriosclerosis
Microphthalmia, Syndromic 10

MCOPS10

Moba

Microphthalmia And Brain Atrophy

Syndromic Microphthalmia 10

Microphthalmia-Brain Atrophy Syndrome

Microphthalmia Syndromic 10

Moba Syndrome

Syndromic Microphthalmia Type 10
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11787 RCL1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus RCL1 MGD MGI:1913275
Canis familiaris RCL1 VGNC VGNC:45444
Bos taurus RCL1 VGNC VGNC:33830
Felis catus RCL1 VGNC VGNC:64550
Rattus norvegicus RCL1 RGD RGD:1305320
Others RCL1 NCBI
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