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SNX20 - sorting nexin 20 Gene

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中文名称：分选 nexin 20

种属: Homo sapiens

同用名: SLIC1

基因 ID: 124460 | 基因类型: protein coding

关于 SNX20

Cytogenetic location: 16q12.1 Genomic coordinates (GRCh38): 16:50,666,300-50,681,312 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 186 orthologues and 1 paralogue. Biased expression in lymph node (RPKM 7.6), appendix (RPKM 6.3) and 12 other tissues.

功能概要

SNX20 与 PSGL1 (SELPLG；MIM 600738) 的细胞质结构域相互作用并将 PSGL1 循环到核内体中。[OMIM 提供，2010 年 2 月]

SNX20 interacts with the cytoplasmic domain of PSGL1 (SELPLG; MIM 600738) and cycles PSGL1 into endosomes.[supplied by OMIM, Feb 2010]

SNX20 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001144972.2 NP_001138444.1 sorting nexin-20 isoform 3
NM_153337.3 NP_699168.1 sorting nexin-20 isoform 2
NM_182854.4 NP_878274.1 sorting nexin-20 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNX20 蛋白结构

PX

PX: PX domain (87 - 185)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 316 a.a.
蛋白主名 其他名称

sorting nexin-20

selectin ligand-interactor cytoplasmic 1

SNX20 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNX20 Q7Z614 FAM9B Homo sapiens Q8IZU0
Y2H Array
31515488
种属内
SNX20 Q7Z614 FAM9B Homo sapiens Q8IZU0
Y2H Array
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 SELPLG Homo sapiens Q14242
Confocal
18196517
种属内
SNX20 Q7Z614 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9
Y2H Array
31515488
种属内
SNX20 Q7Z614 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
Y2H Array
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 ALAS1 Homo sapiens P13196
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 ALAS1 Homo sapiens P13196
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 KLHL12 Homo sapiens Q53G59
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX20 Q7Z614 KLHL12 Homo sapiens Q53G59
Validated Y2H
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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