1. Gene
  2. GGA2 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 Gene

GGA2 - golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 Gene

中文名称:含高尔基体相关,伽马适应蛋白耳,ARF 结合蛋白 2

种属: Homo sapiens

同用名: VEAR

基因 ID: 23062 | 基因类型: protein coding

关于 GGA2

Cytogenetic location: 16p12.2 Genomic coordinates (GRCh38): 16:23,463,542-23,524,359 (from NCBI)

This gene has 17 transcripts (splice variants), 207 orthologues and 10 paralogues. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 28.0), thyroid (RPKM 15.2) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码高尔基体本地化的伽马适应蛋白耳含 ARF 结合 (GGA) 家族的成员。这个家族包括无处不在的外壳蛋白,它们调节反式高尔基体网络和溶酶体之间的蛋白质运输。这些蛋白质共享一个氨基末端 VHS 结构域,该结构域介导反式高尔基体网络中甘露糖 6-磷酸受体的分选。它们还包含与伽马适应蛋白的耳结构域同源的羧基末端区域。该家族成员可能在货物分子调节和网格蛋白包被的囊泡组装中发挥重要作用。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the Golgi-localized, gamma adaptin ear-containing, ARF-binding (GGA) family. This family includes ubiquitous coat proteins that regulate the trafficking of proteins between the trans-Golgi network and the lysosome. These proteins share an amino-terminal VHS domain which mediates sorting of the mannose 6-phosphate receptors at the trans-Golgi network. They also contain a carboxy-terminal region with homology to the ear domain of gamma-adaptins. This family member may play a significant role in cargo molecules regulation and clathrin-coated vesicle assembly. [provided by RefSeq, Jul 2008]

GGA2 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_015044.4 NP_055859.1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11821067 GOA
enables small GTPase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10749927 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in Golgi to plasma membrane protein transport IDA
IDA: 通过直接分析推断
27901063 GOA
involved in protein localization to cell surface IDA
IDA: 通过直接分析推断
27901063 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in clathrin-coated vesicle IDA
IDA: 通过直接分析推断
19478182 GOA
located in trans-Golgi network IDA
IDA: 通过直接分析推断
10749927 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

GGA2 蛋白结构

VHS

VHS: VHS domain (22 - 159)

GAT

GAT: GAT domain (224 - 319)

Alpha_adaptinC2

Alpha_adaptinC2: Adaptin C-terminal domain (488 - 605)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 613 a.a.
蛋白主名 其他名称

ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2

VHS domain and ear domain of gamma-adaptin

GGA2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
GGA2 Q9UJY4 MEMO1 Homo sapiens Q9Y316
Validated Y2H
32296183
种属内
GGA2 Q9UJY4 SORL1 Homo sapiens Q92673
Pull Down
11821067
种属内
GGA2 Q9UJY4 SORL1 Homo sapiens Q92673
Validated Y2H
32814053
种属内
GGA2 Q9UJY4 SORL1 Homo sapiens Q92673
Y2H Array
32814053
种属内
GGA2 Q9UJY4 SORL1 Homo sapiens Q92673
Y2H
11821067
种属内
GGA2 Q9UJY4 SORL1 Homo sapiens Q92673
Y2H Pooling
32814053
种属内
GGA2 Q9UJY4 BACE1 Homo sapiens P56817
Anti Tag CoIP
26053850
种属内
GGA2 Q9UJY4 RABEP1 Homo sapiens Q15276
Y2H
12505986
种属内
GGA2 Q9UJY4 RABEP1 Homo sapiens Q15276
Anti Tag CoIP
12505986
种属内
GGA2 Q9UJY4 RABEP1 Homo sapiens Q15276
Pull Down
10747088
种属内
GGA2 Q9UJY4 RABEP1 Homo sapiens Q15276
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
GGA2 Q9UJY4 RABEP1 Homo sapiens Q15276
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
GGA2 Q9UJY4 GGA1 Homo sapiens Q9UJY5
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
GGA2 Q9UJY4 GGA1 Homo sapiens Q9UJY5
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
GGA2 Q9UJY4 GGA1 Homo sapiens Q9UJY5
Pull Down
14638859
种属内
GGA2 Q9UJY4 GGA3 Homo sapiens Q9NZ52
Pull Down
14638859
种属内
GGA2 Q9UJY4 CA8 Homo sapiens P35219
Y2H Array
25416956
种属内
GGA2 Q9UJY4 SPG21 Homo sapiens Q9NZD8
Y2H Pooling
16189514
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus GGA2 VGNC VGNC:29336
Mus musculus GGA2 MGD MGI:1921355
Rattus norvegicus GGA2 RGD RGD:1304800
Macaca mulatta GGA2 VGNC VGNC:72728
Felis catus GGA2 VGNC VGNC:62533
Canis familiaris GGA2 VGNC VGNC:41194